通过f2py Fortran扩展到Python：如何配置文件？

我在使用f2py（Ver.2）编译的Fortran（gfortran 4.4.7）中编写的扩展名为Python（2.7.2）。通过f2py Fortran扩展到Python：如何配置文件？

我可以使用cProfile来剖析Python部分，但结果并不提供有关Fortran函数的任何信息。相反，时间归因于调用Fortran函数的Python函数。

我已经启用了“-pg O”标志为我打造，以及在f2py呼叫通过创建共享对象的所有的Fortran对象：f2py --opt="-pg -O" ...

如何得到任何提示Fortran信息也非常感谢。

如果有人使用类似的设置，使用不同的分析器，我也会感兴趣。

2013-05-14 NichtJens

FWIW，因为这个原因，我停止使用f2py ......很难进入Fortran代码，看看发生了什么。问题在于Fortran代码被C代码包装，进一步混淆了这种情况。 – SethMMorton 2013-05-14 18:23:59

也许你应该试试pythonic方法：将测试例程放在Python模块的'if __name __ =='__ main __“：'部分是一个好习惯。所以我建议编写一个单独的Fortran程序来分别描述这个部分。 – Stefan 2013-05-15 06:39:10

Fortran函数调用显示为'：84（）'。确实，你无法确定哪个模块被调用，但它给了你一个想法。另一种方法是将其封装到Python函数中，然后查看Python函数的时间。 – ilciavo 2015-06-23 16:42:50

的Fortran函数调用显示为：

<ipython-input-51-f4bf36c6a947>:84(<module>).

我知道，你不能确定被称为该模块，但至少这给你的想法。

另一种方式是将其封装到Python函数中，然后查看Python函数的计时。

来源

2016-06-26 06:42:40 ilciavo

看看python扩展profiler yep。

来源

2014-08-07 20:02:22

该手册说使用'ppref'来读取'file.prof'。你能简单解释一下怎么做吗？ – ilciavo 2015-06-23 16:46:14

我怀疑'pperf'这个名字是一个错字。它可能会说'pprof'（来自Google的[perftools]（http://google-perftools.googlecode.com/svn/trunk/doc/cpuprofile.html）） – 2015-06-24 18:47:45

yep依赖于google-perftools，它有64位的问题系统。从它的文档：“在64位系统上的glibc内置堆栈解卷器在perftools库中存在一些问题”。出于这个原因，我无法使用它。 – Florian 2017-07-10 09:10:25

这个工作流程似乎工作得很好：

1. 使用callgrind分析代码（这会产生像callgrind.out.27237文件）：

valgrind --tool = callgrind python my_python_script_calling_f2py_functions.py arg1 arg2

转换为.DOT文件（如果需要，可以安装与gprof2dot： “PIP安装的git + https://github.com/jrfonseca/gprof2dot”）

gprof2dot -f callgrind callgrind.out.27237> callgrind.dot

创建graphviz的的曲线图（见本计算器问题Interpreting callgrind data）：

点-Tjpg callgrind.dot -o callgrind。jpg

来源

2017-07-10 09:08:59 Florian

通过f2py Fortran扩展到Python：如何配置文件？

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