2017-02-02 75 views
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我需要绘制大脑网络的社区结构。类似于附加的图像。我正在使用图形工具python工具箱。任何帮助创建此将不胜感激。使用图形工具绘制社区结构的图形

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19027073http://journal.frontiersin.org/article/10.3389/fnins.2016.00394/full

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你看过Anaconda吗? –

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我使用图形工具来执行我的分析,使用图形工具中的stochastic_block_models获取社区结构。我只需要使用图形工具的绘图功能获得与上述相似的图形帮助。 – ssm

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如果您发现有用的答案,请点击附近的标记进行接受。 – Peaceful

回答

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所以,如果G是你的图形,你可以安装在标准的随机块模型(即一个没有度校正),以获得社会结构为:

state = gt.minimize_blockmodel_dl(G, deg_corr=False) 

在此之后,你可以使用draw方法这只不过是graph_draw()的包装:

state.draw(pos=g.vp.pos, output="my_graph.pdf") 

希望这会有所帮助。