保存一个R项目时的压缩问题

我通过将R安装目录移出磁盘C解决了这个问题。感谢Joris提供了很好的建议！我认为R核心团队也应该把它当成一个bug，并且对Windows xp的保护机制做些什么。保存一个R项目时的压缩问题

亲爱的社区：

在使用R中的BIOMOD包，我总是得到以下问题：

错误xzfile（文件， “WB”，压缩= 9）：无法打开连接此外：警告消息：在xzfile（文件，“WB”，压缩= 9）：不能初始化LZMA编码器，错误5

它是由包的作者，并且还帮助文件中说的“保存”这个问题应该是由于缺乏写入权限而引起的。但是，当我以管理帐户登录并对所有操作进行评估时，我不知道问题所在。有人可以帮我吗？我真的需要现在运行包。在此先感谢〜

真诚，马尔科

下面是在“拯救”帮助文件中的说明：在当前目录

失败最常见的原因是缺乏写入许可。关于“save.image”和用于在端的会话的这将通过示出的消息等

Error in gzfile(file, "wb") : unable to open connection 
    In addition: Warning message: 
    In gzfile(file, "wb") : 
     cannot open compressed file '.RDataTmp', 
     probable reason 'Permission denied' 
The defaults were changed to use compressed saves for 'save' in 
2.3.0 and for 'save.image' in 2.4.0. Any recent version of R can 
read compressed save files, and a compressed file can be 
uncompressed (by 'gzip -d') for use with very old versions of R.*

抱歉信息的ommision节省：这里是sessionInfo（）：

> sessionInfo() 
R version 2.12.2 (2011-02-25) 
Platform: i386-pc-mingw32/i386 (32-bit) 

locale: 
[1] LC_COLLATE=Chinese_People's Republic of China.936 
[2] LC_CTYPE=Chinese_People's Republic of China.936 
[3] LC_MONETARY=Chinese_People's Republic of China.936 
[4] LC_NUMERIC=C          
[5] LC_TIME=Chinese_People's Republic of China.936  

attached base packages: 
[1] splines stats  graphics grDevices utils  datasets methods 
[8] base  

other attached packages: 
[1] BIOMOD_1.1-6.8  foreign_0.8-42  gam_1.04   
[4] randomForest_4.6-2 mda_0.4-1   class_7.3-3  
[7] gbm_1.6-3.1  lattice_0.19-17 MASS_7.3-11  
[10] Design_2.3-0  Hmisc_3.8-3  survival_2.36-5 
[13] rpart_3.1-48  nnet_7.3-1   ade4_1.4-16  
[16] rgdal_0.6-33  dismo_0.5-19  rJava_0.9-0  
[19] raster_1.7-47  sp_0.9-78   

    loaded via a namespace (and not attached): 
    [1] cluster_1.13.3 grid_2.12.2 tools_2.12.2

现在我发现问题来形成LZMA编码器在做“保存”：

> x<-runif(100) 
> save(x, file = "F:/test.gzip", compress='gzip') 
> save(x, file = "F:/test.xz", compress='xz') 
Error in xzfile(file, "wb", compression = 9) : cannot open the connection 
>

来源

2011-03-01 Marco

您是在基于Windows或Unix的系统上？ – 2011-03-01 02:00:49

什么版本的R和哪个版本的BIOMOD，以及该包在哪里？使用sessionInfo（）获得版本摘要 – mdsumner 2011-03-01 02:33:05

您究竟在哪里保存了您的R版本，以及您拥有哪个版本的Windows？您可以尝试以管理员身份运行R（与具有管理员权限的帐户中运行R不同），或者不将R安装在Program Files文件夹中。问题可能在那里，因为它是Windows下的受保护文件夹。从错误中，似乎无法读取临时文件。 – 2011-03-01 12:19:19

-2

我有一个类似的问题试图在使用8个模型运行建模过程后尝试投影到新场景（包含与预测变量相对应的列的表格）时。

第一个表格（约250,000行）运行良好，我可以将结果保存为.csv文件。然而，第二个（约380,000行）导致上述错误消息，并且一些文件未写入项目文件夹。

我已经把所有的表格都裁减到最多260,000行，我不再收到错误信息。在多次运行中做这件事有点痛苦，但是一旦我写了一次脚本，我就用MS Word中的find和replace来替换每次运行。

来源

2012-08-31 11:21:43

由于建议使用MS-Word编辑与R数据有关的任何内容，因此我投票表决。这是混淆错误和沮丧的根源。 – 2012-08-31 20:37:21

保存一个R项目时的压缩问题

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