聚类点散点图中

Question

比方说，我有这样的data.frame：

df <- data.frame(x = rep(1, 20), y = runif(20, 10, 20)) 

，我想绘制df$y与df$x。

由于x值是常数，所以具有相同或接近y值的点将在一个简单的散点图中彼此重叠，这种类型隐藏了这种y值点的密度。这种情况的一个解决方案当然是使用小提琴剧情。

我正在寻找另一种解决方案 - 绘制点集群而不是单个点，因此看起来会类似于泡沫图。然而，在泡沫图中，为了使泡沫有意义，需要第三个维度，这在我的数据中没有。有没有人知道R函数/软件包作为输入点（可能是一个定义的半径），并将它们聚类并绘制它们？

Answer 1

查看sunflowerplot函数（以及用于计算重叠点的函数xyTable）。

您还可以使用TeachingDemos包中的my.symbols函数，结果为xyTable以使用其他形状（图或示例）。

Answer 2

可以jitter x值：

plot(jitter(df$x),df$y) 

Answer 3

你可以尝试hexplot，即使用hexplot库或GGPLOT2 stat_binhex。

http://cran.r-project.org/web/packages/hexbin/

http://docs.ggplot2.org/0.9.3/stat_binhex.html

Answer 4

其他标准方法（相对于抖动）是使用部分透明的颜色，以使得重叠点将会出现比“孤独”点变暗。

De gustibus等

Answer 5

使用透明度是另一种解决方案。例如： -

ggplot(df, aes(x=x, y=y)) + 
    geom_point(alpha=0.2, size=3) 

当只有一个x值，密度图：

ggplot(df, aes(x=y)) + 
    stat_density(geom="line") 

或小提琴的情节：

ggplot(df, aes(x=x, y=y)) + 
    geom_violin() 

也可能是显示您的数据的选项。