如何在R中指定dist函数的其他方法？

方法要使用的距离度量。这必须是“欧几里德”，“最大”，“曼哈顿”，“堪培拉”，“二进制”或“minkowski”之一。可以给出任何明确的子字符串。

但我需要根据不在列表中的自定义函数计算距离，有没有办法指定它？或者除了适合我情况的dist功能外，还有其他方法吗？

我知道我可以用高兴的方式做到这一点，但我正在寻找一个更好的方法来做到这一点。

谢谢。

编辑：

我使用的Th距离的方法是的关联性分数使用皮尔森距离。有没有一个简便的方法呢？

你能给我们一个实际的例子吗？根据您使用的距离度量值，可能会有不可用的替代方法。但是为了在dist函数中增加一个，你需要修改C代码。 –

'dist'不会隐藏或与方法交织在一起。所以也许只是看看代码的帮助（在你的控制台输入dist并运行它）。基本上你也可以写出你自己的功能，从dist已经为/适合你做的事情开始。 –

@ ran2：问题在于，这些方法是在C代码中实现的，而不是在R代码中执行的...... –

你不能; dist()只知道如何计算一定的距离。有良好的数目在经由CRAN R封装可用的其他距离/不相似性系数（包括vegan，analogue和proxy包，其中包括许多其他。）

后者代理，可特别适合您的需求。它不仅具有大量预先指定的系数，还提供了一个指定自己的距离函数的框架，然后从编译后的代码调用该函数，因此速度相当快。

2011-09-20 11:13:02

谢谢！代理包似乎是我想要的！ –

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