文件有很多行,每行包含壳创建新的目录,并检查它是否存在
INT文件夹名称文件路径文件路径文件路径
如。
1001 AS35_59328 RICwdsRSYHSD11-2-IPAAPEK-93 /ifshk5/BC_IP/PROJECT/T1
1073/T11073_RICekkR/Fq/AS35_59328/111220_I631_FCC0E5EACXX_L4_RICwdsRSYHSD11-2-IP
AAPEK-93_1.fq.gz /ifshk5/BC_IP/PROJECT/T11073/T11073_RICekkR/Fq/AS35_5932
8/111220_I631_FCC0E5EACXX_L4_RICwdsRSYHSD11-2-IPAAPEK-93_2.fq.gz
/ifshk5/BC_IP/PROJECT/T11073/T11073_RICekkR/Fq/AS35_5932
8/111220_I631_FCC0E5EACXX_L4_RICwdsRSYHSD11-2-IPAAPEK-9322121_2.fq.gz
因此如何获取文件夹名称(AS35_59328)并创建文件夹(如果未创建)。
得到行第二部分AS35_59328,如果AS35_59328早已存在,把所有文件的行成文件夹,否则创建AS35_59328文件夹,然后把文件放到
'cut' +'mkdir'? –
你能解释一下你的问题吗? – Suku