在我的公司中，我们正在使用Office365处理我们的电子邮件。 除此之外，我们正在使用Windows Azure Active Directory来保护某些应用程序。Windows Azure Active Directory和Office 365集成
现在我被要求在Office 365和Windows Azure Active Directory中的用户之间创建某种链接。 问题的关键在于使用WAAD部署和保护一些管理应用程序，但用户是Office365的用户。
我在网上发现了很多关于如何同步目录的文档，但没有明确说明这是可能的。
我想坚持一个事实，那就是我们自己的应用程序，我们希望像这样安全。
感谢
当您建立Azure的Subcription你用你使用，当你设置你的Office 365订阅相同的帐户？如果是这样，您应该能够在登录到Azure时看到现有的WAAD实例，该实例已将您的@ *。onmicrosoft.com域注册为它。如果您没有看到您可以将域添加到Azure订阅，前提是您是域管理员。请参阅此处：http://blogs.msdn.com/b/bspann/archive/2013/10/20/adding-existing-o365-directory-to-azure-msdn-subscription.aspx
Office 365的基础目录是Azure Active Directory（AAD）。这意味着如果您有Office 365帐户，则您已在AAD中拥有目录（或“租户”）。
对于您的情况，我认为您想要做的是从保护您的应用程序与不同的AAD租户（位于不同的域）之间，以保护您的应用程序与开始使用Office 365时获得的租户的安全。关键是能够从Azure门户访问您的Office 365租户。
这样做的最简单方法是使用Office 365（admin）帐户登录Azure。如果您没有Azure订阅，则会收到“无订阅”消息，您可以点击“注册”。注册一个免费试用版（您必须输入信用卡信息等，但在试用结束后您实际上不必支付），然后转到“Active Directory”部分。您应该可以看到您的Office 365目录以及您的所有用户。
现在您可以开始为Office 365租户添加和配置应用程序，以便您可以使用该租户来保护您的应用程序。另外：由于您已经开始使用另一个Azure订阅（可能是您的Microsoft帐户，MSA --formerly LiveID--），因此在一个帐户下管理所有内容有时很有用。您拥有的一个选项是将MSA添加为Office 365租户的管理员（请注意，这仅适用于您通过Azure门户所做的工作）。为此，请使用您的Office 365管理员帐户登录Azure门户，转到您的目录，然后单击添加用户。您会看到添加Microsoft帐户的选项：这样做。现在注销并使用MSA重新登录，您应该在“Active Directory”下看到一个新目录，并且可以验证这是您的Office 365目录。
额外附加费用：也可以将您的Office 365用户帐户添加为现有MSA订阅的共同管理员（反之亦然）。
感谢Philippe！你在足球场外很有价值！ – nimatra
如果目的是使在Azure门户中提供的Office 365的目录中，目前从事：
在Azure的门户网站，活动目录下，点击新建按钮，然后目录，然后创建自定义。在目录下拉菜单中，选择“使用现有目录”并按照说明注销并使用Office 365管理员用户登录。这将使您的Office 365目录在Azure门户中可用（除了您有权访问的任何其他Azure目录之外）。
为了完成，我希望OP会回来接受Philippe提供的答案。
当您登录到Windows Azure管理门户网站，你在使用Microsoft帐户（又名直播Id）的签名或者您使用的组织帐户登录一个来自您的Office 365目录的用户？ –