R data.table有条件查找/替换

Question

我有一个data.table（sbd_sbmolbio_n）。我需要找到2个条件为真行：

ORF_SEQUENCE包含“MKTIIALSYIFCLVFA”

N_TAG包含‘信号序列’

然后我需要更换N_TAG的‘信号序列’的一部分“ HA”，不过该字符串的其余部分，则（例如，‘信号序列，10XHis-TEV’变成了‘HA-10XHis-TEV’

我想这一点：

sbd_sbmolbio_n[grep("MKTIIALSYIFCLVFA",ORF_SEQUENCE),][grep("Signal Seq", N_TAG), N_TAG := sub("Signal Seq", "HA", N_TAG)] 

它正在查找行，但未进行替换。有什么想法吗？

Answer 1

第一组括号返回data.table，这不是原来的data.table了，然后你正在修改那个。要做到这一点的地方 - 结合这两个条件（请注意使用的grepl代替grep）：

sbd_sbmolbio_n[grepl("MKTIIALSYIFCLVFA",ORF_SEQUENCE) & grepl("Signal Seq", N_TAG), 
       N_TAG := sub("Signal Seq", "HA", N_TAG)]