Bash代码分裂每4行然后合并

也许我的标题不能完全解释我的意图。我有数据列表如下图所示：Bash代码分裂每4行然后合并

@HWI-ST150_0129:3:8:21208:93107#0/1 
TGTCTAGTTTTTATAGGAAGATATTTCCTTTTCTACCTTTGACTTCAAAGCGGCTGAAATCTCCACTTGCAAATTCCACAAAAAGAGTGTTACAAGTCT 
+ 
Yeeeeeeeeeceed]dddddd^YdceeeedaeeddYccccc\ddceeYeYY`[`bcYc^_XY^_]d^dd`abdddee\e\ddLb]`_`cTbbbYbaM_] 
@HWI-ST150_0129:3:8:21208:93107#0/2 
TTTGTAAAGTCTGCACGTGGATAACTTGACCACTTAGAGGCCTTCGTTGGAAACGGGTTTTTTTCATGTAAGGCTAGACAGAAGAATTCTCAGTAACTTCAAGTTACTGAGAATTCTTCTGTCTAGCCTTACATGAAAAAAACCCGTTTCCAACGAAGGCCTCTAAGTGGTCAAGTTATCCACGTGCAGACTTTACAAA 
+ 
ffcaefffcdeeeeeeeeeedff^f`\\eeedaec^d^d`deaffeeTecb^bbbddadYcccW[X\MZ\XaU_UTI\]TZ]K[VQX^aIb`b`^X^YSYHWI-ST150_0129:3:8:21208:93107#0

我们可以看到第一线和5日线都是头/名称，但无论是＃0/1或＃0/2结束。现在我希望将每4行分组，但后来将所有＃0/1和＃0/2合并在一起。

应该是这样的：

@HWI....#0/1 
TTCCGC 
+ 
cffccc 
@HWI....#0/1 
CCGGGG 
+ 
abbcgg 
....

也是另一个文件是： @HWI ....＃0/1 ATTCCG + fccfcc @HWI ....＃0/1 CGCCGG + gbbcaa

我知道如何用一个简单的python脚本来做到这一点。但只是想知道我们是否只能用一些非常简单的bash代码来做呢？感谢

来源

2011-11-18 user815408

sed -n '1,${p;n;n;n;}'应该让每4个行工作：

[ 11:32 [email protected] ~/SO/bash ]$ cat blah | sed -n '1,${p;n;n;n;}' 
@HWI-ST150_0129:3:8:21208:93107#0/1 
@HWI-ST150_0129:3:8:21208:93107#0/2 

[ 11:33 [email protected] ~/SO/bash ]$ cat blah 
@HWI-ST150_0129:3:8:21208:93107#0/1 
TGTCTAGTTTTTATAGGAAGATATTTCCTTTTCTACCTTTGACTTCAAAGCGGCTGAAATCTCCACTTGCAAATTCCACAAAAAGAGTGTTACAAGTCT 
+ 
Yeeeeeeeeeceed]dddddd^YdceeeedaeeddYccccc\ddceeYeYY`[`bcYc^_XY^_]d^dd`abdddee\e\ddLb]`_`cTbbbYbaM_] 
@HWI-ST150_0129:3:8:21208:93107#0/2 
TTTGTAAAGTCTGCACGTGGATAACTTGACCACTTAGAGGCCTTCGTTGGAAACGGGTTTTTTTCATGTAAGGCTAGACAGAAGAATTCTCAGTAACTTCAAGTTACTGAGAATTCTTCTGTCTAGCCTTACATGAAAAAAACCCGTTTCCAACGAAGGCCTCTAAGTGGTCAAGTTATCCACGTGCAGACTTTACAAA 
+ 
ffcaefffcdeeeeeeeeeedff^f`\\eeedaec^d^d`deaffeeTecb^bbbddadYcccW[X\MZ\XaU_UTI\]TZ]K[VQX^aIb`b`^X^YSYHWI-ST150_0129:3:8:21208:93107#0

Useful One-Line Scripts For sed
man sed

来源

2011-11-18 19:33:57 chown

无用使用猫| sed;）参见http://partmaps.org/era/unix/award.html –

@sputnick是的，我知道'sed -n'1，$ {p; n; n; n;}'FILE'就像好吧，但现在它的这种习惯是“猫”的一切= p。它不像'猫FILE |'那么糟糕尽管= p。 – chown

我不知道我理解你，但是让每4行是琐碎GNU sed的：

sed '1~4!d' file

至group分四行，通过该我想你的意思是减少4行到一个：

sed '/#0\/[12]$/{N;N;N;s/\n//;d}' file

这使用您上面即在#0/1或#0/2结束的行中提到的正则表达式

来源

2011-11-18 21:01:27 potong

Bash代码分裂每​​4行然后合并

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