在R Sweave（Knitr）中使用R Markdown块

我有一个R Markdown文件，其中包含我的笔记和代码块。我现在想编写一个R Sweave（Knitr）文档来发布使用这些块的论文。我不想剪切和粘贴大块，而是直接给它们打电话。这样，如果我更新大块，我不必在两个地方做。它似乎很简单，但我无法弄清楚。我的代码如下，test.rmd是我的标记文件，foo是rmd文件中的块。在R Sweave（Knitr）中使用R Markdown块

Test.rnw

<<Setup>>=== 
read_chunk('test.rmd') 
@ 
<<foo>>== 
@

Test.rmd

```{r foo, echo=TRUE} 
    print(summary(cars)) 
```

我会希望显示在输出test.rnw汇编成PDF汽车的摘要。但我不知道。任何帮助是极大的赞赏。

来源

2014-03-31 tcalderwood

你读过帮助页面？ “注意该函数只能用于没有被缓存的块（块选项cache = FALSE），并且代码被读取并存储在当前会话中而不被执行（为了实际运行代码，必须使用一个带有相应标签的块）“。 –

我以为这就是我所做的。默认情况下，cache = FALSE，我使用了一个带有相应标签的块。我的chuck代码被称为foo，我使用<> ==来调用它。也就是说，除非我完全错过了这条船。 – tcalderwood

read_chunk读取从r脚本块这样称呼purl前read_chunk：

<<Setup>>= 
knit_patterns$set(all_patterns[["md"]]) 
purl("test.Rmd") 
knit_patterns$set(all_patterns[["rnw"]]) 
read_chunk("test.R") 
@ 

<<foo>>= 
@

来源

2014-04-01 09:12:14 kohske

当我从控制台运行purl和read_chunk时，我用我的块获得一个R文件。然后我复制并将您的示例粘贴到我的rnw文件中。当rnw文件被编译成PDF时，R文件被生成，但是是空的。我确定我的目录设置正确，文件正在被purl读入。所以，我为什么要得到一个空的R文件是一个失败。 – tcalderwood

您可能需要明确设置模式。查看已更新。 – kohske

非常感谢你！它正是我所需要的。这将使我的学习和研究变得如此简单。再一次，非常感谢你。 – tcalderwood

在R Sweave（Knitr）中使用R Markdown块

回答

相关问题