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sample = ['AAAA','CGCG','TTTT','AT$T','ACAC','ATGC','AATA']
Position = [0, 1, 2, 3, 4, 5, 6]
我有上面的示例与每个元素相关联的位置。我做滤波的几个步骤,这些步骤的代码被赋予here.如何在列表中的元素被分类为对(Python)之后保留原始列表的位置值?
在消除步骤是:
#If each base is identical to itself eliminate those elements eg. AAAA, TTTT
#If there are more than 2 types of bases (i.e.' conversions'== 1) then eliminate those elements eg. ATGC
#Make pairs of all remaining combinations
#If a $ in the pair, then the corresponding base from the other pair is eliminated eg. (CGCG,AT$T) ==> (CGG, ATT) and (ATT, AAA)
#Remove all pairs where one of the elements has all identical bases eg. (ATT,AAA)
最后,我有与上述的不同组合的输出如下所示。
我需要找到一种方式,使我得到这些对相对于原始样本的位置如下。
Position = [[1,3],[1,4],[1,6],[3,4]]
工作,但现在我必须在这里改变我的整个程序(HTTPS ://eval.in/662091)合并这个。没有一种方法可以在不妨碍代码的情况下对其进行外部跟踪? – biogeek
@biogeek你应该发布你的程序。我将能够更好地帮助你。 – naomik