通过os.system将变量从python传递到bash shell脚本

在下面的代码中，我构建了一个变量$ probe1，然后传递给bash脚本。我是下面的玩具示例，输出是空白的，即$ probe1不能识别os.system调用中的bash shell脚本。需要做什么？通过os.system将变量从python传递到bash shell脚本

for line1 in datfile: 
    datmat=datmat+[line1.rstrip('\n').split('\t')] 
     probe=datmat[i][0] 
     snp1=datmat[i][2] 
    probe1='permprobes'+probe+'pheno.pphe' 
    os.system('echo $probe1')

来源

2012-12-19 user1815498

'PROBE1 =“...”'套一个Python变量。它与Bash无关。 – Blender

是否有某种方法可以将变量从python传递到bash shell？这基本上是我的问题。 – user1815498

你为什么需要这样做？ – Blender

好像这是你正在尝试做的：

In [2]: os.environ['probe1'] = 'hello' 

In [3]: os.system('echo $probe1') 
hello

但我不知道为什么你想做到这一点...

来源

2012-12-19 01:14:01 satoru

我使用python从数据文件中提取一些变量名，然后我需要将它传递给bash shell脚本以在另一个程序中运行。 echo的例子只是一个“玩具”脚本来说明将变量从python移动到bash shell的问题。 – user1815498

@ user1815498也许你可以使用'pipe'来做到这一点：http://docs.python.org/2/library/subprocess.html – satoru

无论如何，你提出的os.environ []解决方案解决了我的问题。感谢您的管道引用，当我需要将多个变量从python传递到shell时，它会派上用场。 – user1815498

os.system('echo {0}'.format(probe1))

PROBE1是一个python变量，而不是一个shell变量。

os.environ['probe1'] = probe1

将设置bash环境变量为python变量内容。一旦python脚本退出，环境变量就会消失。

来源

2012-12-19 01:09:30 jgritty

我知道，我的问题是我如何将一个python变量传递给bash shell。 – user1815498

通过os.system将变量从python传递到bash shell脚本

回答

相关问题