的内部函数一些背景资料:更改包装
我不得不使用功能HMR
从包HMR
了很多。不幸的是,这个功能非常慢。 (HMR
本质上是一个拟合函数,它被设计为尽可能健壮,这是缺乏效率的一个原因。)函数HMR
调用函数HMR::.HMR.fit1
,它进行实际拟合。 使用Rprof
我知道关于效率的主要问题是使用lsfit
,这被称为很多。因此,我修改了.HMR.fit1
的代码,直接调用lsfit
使用的C函数,而没有lsfit
的所有开销,这应该导致显着的速度增益。
现在我想用我的修改函数替代HMR::.HMR.fit1
,如果测试结果相同,测试HMR
我得到的速度也是多少。
我试着这样做:
mod.fun <- function(<many args>) {
<a lot of code>
}
environment(mod.fun) <- environment(.HMR.fit1)
.HMR.fit1 <- mod.fun
然而,HMR::.HMR.fit1
不这样做改变了,显然HMR::HMR
不使用我修改的拟合函数。有没有一种方法可以实现我想要的功能,而无需从源代码构建软件包,但由于我的(Windows)计算机上的用户权限限制,我无法做到这一点?
现在,我的解决方案是复制HMR::HMR
的代码,但我希望有一个更方便的解决方案。
如果您想添加新功能而不是修改旧功能,请使用以下解决方案:http://stackoverflow.com/a/3402159/684229 – TMS