Python和Rpy2：使用具有“。”的选项调用绘图函数。在他们

我刚开始学习如何使用python与rpy2。我能够做出简单的情节等，但我遇到了R中的许多选项使用“。”的问题。例如，这里的的R呼叫工作的：Python和Rpy2：使用具有“。”的选项调用绘图函数。在他们

barplot（T，COL = heat.colors（2），names.arg = C（ “PWN”， “PWN2”））

其中t是矩阵。

我想在python中使用相同的调用，但它拒绝“。”部分names.arg。我的理解是，在Python中你替换了“。”用“_”表示，例如names_arg，但这也不起作用。我知道这是一个基本的问题，所以我希望有人看到了这一点，并知道修补程序。谢谢！

来源

2010-01-23 Andy Hall

您可以使用字典这里命名参数（using **），如文档described，并直接对函数调用R上。另外请记住，RPy2预计其own vector objects。是的，这是一个有点尴尬，但在好的方面，你应该能够做到在rpy2任何你能在R.

from rpy2 import robjects 
color = robjects.r("heat.colors")() 
names = robjects.StrVector(("pwn", "pwn2")) 
robjects.r.barplot(t, col=color, **{"names.arg":names})

做（注意，这是rpy2 2.0.x版本;还有一些。在unreleased 2.1变化，这我还没有机会看还）

来源

2010-01-24 03:13:26 Noah

这工作就像一个魅力 - 谢谢！ –

我不知道Rpy是否会接受这个，但是您可以在其中包含带有句点的关键字参数。你必须通过字典传递它们。就像这样：

>>> def f(**kwds): print kwds 
... 
>>> f(a=5, b_c=6) 
{'a': 5, 'b_c': 6} 
>>> f(a=5, b.c=6) 
Traceback ( File "<interactive input>", line 1 
SyntaxError: keyword cant be an expression (<interactive input>, line 1) 
>>> f(**{'a': 5, 'b.c': 6}) 
{'a': 5, 'b.c': 6}

来源

2010-01-24 00:34:02

这真的很有帮助，尤其是与答案2结合。现在所有修复，谢谢！ –

在这种情况下，您应该将这个或其他答案标记为已接受。 –

随着rpy2-2.1.0，写一个方式，它是：

from rpy2.robjects.packages import importr 
graphics = importr("graphics") 
grdevices = importr("grDevices") 

graphics.barplot_default(t, 
         col = grdevices.heat_colors(2), 
         names_arg = StrVector(("pwn", "pwn2")))

不必使用barplot_default（而该barplot）是由于大量使用省略号'...'在R的功能签名和d ，因为保存参数名称转换将需要对功能包含的R代码进行分析。

更多，以及执行系统翻译 ''的功能示例。 '_'在： http://rpy.sourceforge.net/rpy2/doc-2.1/html/robjects.html#functions

来源

2010-01-26 19:27:00 user258198

Python和Rpy2：使用具有“。”的选项调用绘图函数。在他们

回答

相关问题