处理（遍历）数（HDF5）文件和几个节点在每个HDF文件

Question

我怎么能自动处理提升的文件名和数组名称中与NumPy：

我有一个名为一系列HDF5文件：

20120101.hdf5, 20120102.hdf5, 20120103.hdf5, ..., 20120130.hdf5, 20120131.hdf5 

每个HDF5文件中包含多个阵列的命名：

array1, array2, array3, ..., array24 

我想seperately修改每个阵列，然后创建相应的新HDF5文件。例如，使用20120101.hdf5：

import numpy 
import tables 

file = openFile("20120101.hdf5","r") 
b1 = file.root.array1 
c1 = (b1<=1) 
new20120101_array1 = creatArray('/','1',c1) 
c2 = ((b1<=2) and (b>1)) 
new20120101_array1 = creatArray('/','2',c2) 
. 
. 
. 

c20 = ((b1<=20) and (b>19)) 
new20120101_array1 = creatArray('/','20',c20) 

并对数组2-24重复它。其结果是，我想有：

new20120101.hdf5 ---- new20120101_array1 ---- 1 
               2 
               ... 
               20 
       ---- new20120101_array2 ---- 1 
               ... 
               20 
       ... 
       ---- new20120101_array24 --- 1 
               ... 
               20 
new20120102.hdf5 
.... 
new20120131.hdf5 

Answer 1

如果你在一个目录有几个文件，你可以使用os.listdir函数返回一个包含在目录中的条目名称的列表。

例子：

import os 
import tables 

direc = '/Users/cg/' # the working directory (where your files are stored) 
dirs = os.listdir(direc) 

for idir in dirs: # this will iterate over the files in your working directory 

    if idir.endswith('.he5'): # only for HDF5 files... 
     hdf5 = tables.openFile(os.path.join(direc,idir)) 

     #### DO WHAT YOU WANT WITH EACH FILE! 

     hdf5.close() 

你的问题的另一部分是已经在你的other question回答，我猜（你可以使用walkNodes功能）。