在R中写入二进制文件

Question

我被要求在两个二进制文件中写入R输出，一个索引文件和一个主数据文件。在索引文件中将有一个对应于每个id的矩阵/块。我已经阅读了关于在互联网上编写R中的二进制文件，但我不知道如何指定格式，以便我可以实现这种格式？

另外，我们可以指定R中的短整数吗？他说他希望这些数字是短交易（两个字节），我不希望这意味着什么。

我很欣赏任何输入！谢谢

Answer 1

查看帮助（writeBin），size = 2定义了对每个元素的分配（即一个两字节的整数）。但是，如果你不知道这意味着什么，那么你可能需要来自请求者的更多信息。

Answer 2

由于您没有很清楚地指出问题，所以我在下面的示例代码中做了一些假设。给定一个矩阵列表，它将它们保存到一个.bin文件并创建一个带有偏移量的.idx文件。您可以在给定索引的情况下再次将它们加载回去。您提到的2字节大小未被使用 - 它将矩阵数据保存为8字节双精度或4字节整数（但您可以更改它）。

这里是如何使用它：

mtx <- list(matrix(1:12,4), matrix(sin(1:12),4)) 
saveMatrixList("c:/foo", mtx) 

loadMatrix("c:/foo", 1) 
loadMatrix("c:/foo", 2) 

...这里的功能是：

saveMatrixList <- function(baseName, mtxList) { 
    idxName <- paste(baseName, ".idx", sep="") 
    idxCon <- file(idxName, 'wb') 
    on.exit(close(idxCon)) 

    dataName <- paste(baseName, ".bin", sep="") 
    con <- file(dataName, 'wb') 
    on.exit(close(con)) 

    writeBin(0L, idxCon) 

    for (m in mtxList) { 
     writeBin(dim(m), con) 
     writeBin(typeof(m), con) 
     writeBin(c(m), con) 
     flush(con) 

     offset <- as.integer(seek(con)) 
     cat('offset', offset) 
     writeBin(offset, idxCon) 
    } 

    flush(idxCon) 
} 

loadMatrix <- function(baseName = "data", index) { 
    idxName <- paste(baseName, ".idx", sep="") 
    idxCon <- file(idxName, 'rb') 
    on.exit(close(idxCon)) 

    dataName <- paste(baseName, ".bin", sep="") 
    con <- file(dataName, 'rb') 
    on.exit(close(con)) 

    seek(idxCon, (index-1)*4) 
    offset <- readBin(idxCon, 'integer') 

    seek(con, offset) 
    d <- readBin(con, 'integer', 2) 
    type <- readBin(con, 'character', 1) 
    structure(readBin(con, type, prod(d)), dim=d) 
}