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就R控制台中,我可以看到系统2()的输出:knitr未能打印出系统2()输出
> STAR<-'/opt/NGS/STAR/STAR-2.5.2b/bin/Linux_x86_64_static/STAR'
> system2(STAR,'--version')
STAR_2.5.2b
但是,当我有一个.Rnw一个块文件等这样的:
\begin{frame}[fragile]{Global STAR settings}
<<echo=TRUE, results="asis">>=
STAR<-'/opt/NGS/STAR/STAR-2.5.2b/bin/Linux_x86_64_static/STAR'
system2(STAR,'--version')
@
\end{frame}
它应该在页面上打印出STAR_2.5.2b
,但没有打印任何内容。有人知道为什么吗?
尝试设置'stdout = TRUE',即'system2(STAR,'version',stdout = TRUE')'。 –
感谢您的建议!它现在已经修复了。 –