有人可以解释R中pvclust函数的输出吗？

Question

在R中的pvclust包中，有pvclust()函数。在功能帮助文件中提供的示例中，有以下功能：

boston.pp <- pvpick(boston.pv) 

这应该打印出具有高p值的群集。这个函数的输出是：

$clusters 
$clusters[[1]] 
[1] "rm" "medv" 

$clusters[[2]] 
[1] "zn" "dis" 

$clusters[[3]] 
[1] "crim" "indus" "nox"  "age"  "rad"  "tax"  "ptratio" "lstat" 


$edges 
[1] 3 5 9 

我很难理解输出的含义，尤其是因为我对聚类分析的技术背景非常有限。特别是，我不明白每个群集下的名称向量的含义。有人可以为我解释吗？谢谢！

Answer 1

https://cran.r-project.org/web/packages/pvclust/pvclust.pdf 描述pvclust：

对于表示为数据为（N×P）矩阵或数据帧，我们假定数据为p对象，将被集群的N个观测。的第i行矢量对应于这些对象的第i个观察和第j列向量对应于第j个对象物的样品与大小为n

输出pvpick的：

cluster - 字符串向量列表。每个矢量对应于每个群集中对象的名称。

您是否绘制了pvclust输出的树状图？ pvpick clusters输出只列出了内部点（pvclust将波士顿数据集中的每个列作为一个点），在某些聚类中，如果绘制它，您将在树状图中看到它。