麻烦在Matplotlib/Scipy等使用胶乳

我有我的第一次尝试使用matplotlib和scipy来做我的数据的一些散点图（太多变量，试图一次看到许多事情）的一些问题。下面是我的一些代码，工作相当好...麻烦在Matplotlib/Scipy等使用胶乳

import numpy 
from scipy import * 
import pylab 
from matplotlib import * 
import h5py 

FileID = h5py.File('3DiPVDplot1.mat','r') 
# (to view the contents of: list(FileID)) 
group = FileID['/'] 
CurrentsArray = group['Currents'].value 
IvIIIarray = group['IvIII'].value 
PFarray = group['PF'].value 
growthTarray = group['growthT'].value 
fig = pylab.figure() 
ax = fig.add_subplot(111) 
cax = ax.scatter(IvIIIarray, growthTarray, PFarray, CurrentsArray, alpha=0.75) 
cbar = fig.colorbar(cax) 
ax.set_xlabel('Cu/III') 
ax.set_ylabel('Growth T') 
ax.grid(True) 
pylab.show()

我试图修改代码，包括乳胶字体和解释，没有它似乎为我工作，但是。这里有一个例子尝试，没有工作：

import numpy 
from scipy import * 
import pylab 
from matplotlib import * 
import h5py 

rc('text', usetex=True) 
rc('font', family='serif') 

FileID = h5py.File('3DiPVDplot1.mat','r') 
# (to view the contents of: list(FileID)) 
group = FileID['/'] 
CurrentsArray = group['Currents'].value 
IvIIIarray = group['IvIII'].value 
PFarray = group['PF'].value 
growthTarray = group['growthT'].value 
fig = pylab.figure() 
ax = fig.add_subplot(111) 
cax = ax.scatter(IvIIIarray, growthTarray, PFarray, CurrentsArray, alpha=0.75) 
cbar = fig.colorbar(cax) 
ax.set_xlabel(r'Cu/III') 
ax.set_ylabel(r'Growth T') 
ax.grid(True) 
pylab.show()

我使用Fink安装python26与SciPy的matplotlib等相应的包我一直在使用IPython的和人工的工作，而不是在Python脚本。

由于我对python和scipy完全陌生，所以我确信我正在犯一些愚蠢的简单错误。请赐教！我非常感谢帮助！

来源

2010-05-18 AllenH

代码对我来说看起来不错，特别是rc命令。

查看本页：Text Rendering with LaTeX。确保安装了LaTeX，dvipng和ghostscript。同时检查你正在使用的后端;你的可能不支持LaTeX。

来源

2010-05-18 07:10:11

史蒂夫！感谢您的评论，我感谢您对此的看法。我正在运行基于--verbose-helpful标志的MacOSX后端（版本未知）。更多信息 - matplotlib 0.99.0（fink上可用） tzinfo.py提供了一个弃用警告，因为我相信即将发布的py30版本。 – AllenH 2010-05-18 17:56:48

顺便说一句，我应该提到我得到更简单的情节乳胶输出的实例，所以我试图以这种方式追踪它。由于某种原因，上面的代码甚至不会输出正常的散点图 - 所以有些线路正在越过某处 - 我怀疑我使用python/scipy是不正确的。 – AllenH 2010-05-18 17:57:54

对于那些刚刚开始SciPy的/ matplotlib，我发现这是很有帮助的寻找我的安装信息，因为我目前使用它......从这个link：

创建一个名为simple_plot.py这包括最小脚本：

from pylab import * 
plot([1,2,3]) 
show()

然后运行在命令行以下操作：

python simple_plot.py --verbose-helpful

我接收到的结果是：

$HOME=/Users/me 
CONFIGDIR=/Users/me/.matplotlib 
matplotlib data path /sw/lib/python2.6/site-packages/matplotlib/mpl-data 
loaded rc file /sw/lib/python2.6/site-packages/matplotlib/mpl-data/matplotlibrc 
matplotlib version 0.99.0 
verbose.level helpful 
interactive is False 
units is False 
platform is darwin 
Using fontManager instance from /Users/me/.matplotlib/fontList.cache 
/sw/lib/python2.6/site-packages/pytz/tzinfo.py:5: DeprecationWarning: the sets module is deprecated 
    from sets import Set 
backend MacOSX version unknown

我希望这可以帮助刚刚开始像我一样的人！ :)感谢大家对此的看法！

来源

2010-05-18 18:02:09 AllenH

麻烦在Matplotlib/Scipy等使用胶乳

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