如何避免与NumPy + MKL这四行内存泄漏？

下面简单的四线代码产生一个内存泄漏在我的Python 2.6.6/NumPy的1.7.0/MKL 10.3.6设置：如何避免与NumPy + MKL这四行内存泄漏？

import numpy as np 

t = np.random.rand(10,10) 
while True: 
    t = t/np.trace(t)

随着每次操作中，所使用的存储器的增长通过的大小一个10x10矩阵。但是，当我使用NumPy 1.4.1/ATLAS设置时没有这种行为。

我已阅读关于MKL不一定自动释放内存，所以我想这是爆炸的原因。有没有一种简单的方法来修改NumPy（编译之前或之后），这样这个四行可以正常工作？

输出np.show_config（）的

numpy 1.7.0 

lapack_opt_info: 
    libraries = ['mkl_rt', 'pthread'] 
    library_dirs = ['$MKLPATH/lib/intel64'] 
    define_macros = [('SCIPY_MKL_H', None)] 
    include_dirs = ['$MKLPATH/include'] 
blas_opt_info: 
    libraries = ['mkl_rt', 'pthread'] 
    library_dirs = ['$MKLPATH/lib/intel64'] 
    define_macros = [('SCIPY_MKL_H', None)] 
    include_dirs = ['$MKLPATH/include'] 
lapack_mkl_info: 
    libraries = ['mkl_rt', 'pthread'] 
    library_dirs = ['$MKLPATH/lib/intel64'] 
    define_macros = [('SCIPY_MKL_H', None)] 
    include_dirs = ['$MKLPATH/include'] 
blas_mkl_info: 
    libraries = ['mkl_rt', 'pthread'] 
    library_dirs = ['$MKLPATH/lib/intel64'] 
    define_macros = [('SCIPY_MKL_H', None)] 
    include_dirs = ['$MKLPATH/include'] 
mkl_info: 
    libraries = ['mkl_rt', 'pthread'] 
    library_dirs = ['$MKLPATH/lib/intel64'] 
    define_macros = [('SCIPY_MKL_H', None)] 
    include_dirs = ['$MKLPATH/include']

来源

2013-03-03 cm_

这绝对看起来像一个在numpy中的错误。也许你会有更多的运气提交给他们的bug跟踪器或尝试numpy 1.8？ – entropy 2013-03-03 22:56:14

有趣的是，在循环中的[gc.collect]（[gc - garbage collection]（http://docs.python.org/2/library/gc.html））中指向一个numpy错误仍然会发生这种效果。也许值得提出他们的问题跟踪？ – danodonovan 2013-03-03 22:58:32

谢谢，我已将此问题提交给numpy错误跟踪程序。一旦我在那里得到肯定的答复，我会尽快结束这个问题。 – 2013-03-03 23:50:59

这确实是一个NumPy的错误，已经知道了一段个月，已经讨论here;它将在1.7.1中修复。该修复程序是this nice one-liner in item_selection.c。加入这条线并重新编译后，一切正常。

来源

2013-03-04 00:28:24

如何避免与NumPy + MKL这四行内存泄漏？

回答

相关问题