使用subprocess.Popen（）执行xmgrace批处理（）

我必须从包含数据的多个文件制作图形。我已经找到了一种方法来运行一个简单的命令使用subprocess.Popen（）执行xmgrace批处理（）

xmgrace -batch batch.bfile -nosafe -hardcopy

其中batch.bfile是有风度命令的文本文件打印我想要的图形。我已经尝试过它手动，它完美的作品。要做到这一点与几个文件，我只需要编辑batch.b文件中的一个参数，并在每次进行更改时运行相同的命令。

我已经编写了一个编辑batch.bfile的python代码，并通过for循环遍历所有的数据文件。在每个循环步骤中，我想直接在命令行中运行所提到的命令。

搜索了一下后，我发现了两个解决方案，一个与使用os.system（），另一个与subprocess.Popen（）和我只能作出subprocess.Popen（）不通过书面形式给予的任何错误的工作：

subprocess.Popen("xmgrace -batch batch.bfile -nosafe -hardcopy", shell=True)

问题是，这在实践中并没有做任何事情，即它与在命令行中直接运行命令不同。我已经尝试编写batch.b文件的完整目录，但没有任何更改。

我使用Python 2.7和Mac OS 10.7

来源

2011-07-25 operte

没有更改，因为在nothign返回或打印？ – thabubble

恩，我的意思是没有文件生成。如果我直接在命令行中运行命令，图形将正常生成并且没有任何问题。 – operte

你是否检查过使用sh命令行运行xmgrace？（即调用/ bin/sh，然后运行xmgrace ...应该与您在设置shell = true时Popen使用的shell相同）。

另一种解决方案是创建一个shell脚本（创建一个像myscript.sh这样的文件，并从终端运行chmod + x）。在脚本调用xmgrace显示：

#!/bin/bash 
xmgrace -batch batch.bfile -nosafe -hardcopy

然后，您可以测试myscript.sh的作品，应该拿起任何环境变量，可能是您的个人资料可能从蟒蛇不同。如果这样，你可以从python的subprocess.Popen（'myscript.sh'）调用脚本。您可以通过运行来检查python中是否为子进程设置了环境变量：

import os 
os.environ

来源

2011-07-26 22:12:58

我并没有完全理解环境变量的含义，因为我不太了解它们在这些环境中的功能。不过，我创建了一个名为batch.sh的文件，通过在“./batch.sh”（在chmod -x'ing之后）键入我想要的目录并将它运行完毕。在python中，我尝试了subprocess.Popen（“./ batch.sh”），但没有发生任何事情：\我也尝试了完整的目录，但没有：\ – operte

是的，我调用/ bin/sh，运行相同的命令，罚款：\ – operte

你是对的，我终于明白你的意思是什么PATH的东西，是的，xmgrace不是在python的路径。通过在脚本中写入xmgrace的完整路径，我可以使所有内容正常工作。非常感谢你，原谅我对环境变量的无知。 – operte

你可能想看看http://sourceforge.net/projects/graceplot/

来源

2011-07-26 07:21:41 thabubble

这样处理数据的速度与正常情况下一样快吗？我问这是因为之前我用python和matplotlib来做我的情节，并且因为大量的数据（100k +元素）而停下来，python只是在挣扎着：\我不知道它是python还是matplotlib的错。 – operte

它可能会让你头脑发热，但应该像恩典一样快，你可以试试看它是否是，我找不到有关速度的任何信息。 – thabubble

使用时使用POPEN，你可以捕捉应用程序的输出到标准输出到标准错误，你的应用程序中打印 - 这样你可以看到发生了什么：

from subprocess import Popen, PIPE 
ps = Popen(reportParameters,bufsize=512, stdout = PIPE, stderr = PIPE) 
if ps: 
    while 1: 
     stdout = ps.stdout.readline() 
     stderr = ps.stderr.readline() 
     exitcode = ps.poll() 
     if (not stdout and not stderr) and (exitcode is not None): 
     break 
     if stdout: 
     stdout = stdout[:-1] 
     print stdout 
     if stderr: 
     stderr = stderr[:-1] 
     print stderr

来源

2011-07-26 09:03:48

问题是这个命令不会产生任何输出。它只会在batch.b文件中指定的文件夹中生成一个图形：\ – operte

您是否为xmgrace和batch.b文件编写了完整路径？有时python的工作目录在一个意想不到的地方 - 可能是输出在那里登陆。尝试在你的代码导入操作系统，并打印os.path.realpath（'。'） –

我把这段代码你建议我在python中，输出是这样的：./batch.sh：第2行：找不到命令xmgrace：。这是否与你所谈论的环境有关？ – operte

使用subprocess.Popen（）执行xmgrace批处理（）

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