一个图中的多个部分依赖关系图

Question

我正在使用randomForest包与Partialplot function。

我想在一个图中制作多个部分依赖关系图。我的论文创始人告诉我可以保存它们（在环境中，我做了这个，并且我得到了一个列表对象，在该列表中有'x'和'y'变量），但我不知道如何回忆保存之后的图表。

我想要做的是：

保存PD地块

2.召回他们

情节多个PDP在一个图形

Answer 1

而不是使用partialPlot函数，请考虑在0中使用plotmo函数包。这将在单个页面上绘制所有变量和变量对的图。例如：

library(randomForest) 
data(trees) 
mod <- randomForest(Volume~., data=trees) 
library(plotmo) 
plotmo(mod, pmethod="partdep") # plot partial dependencies 

这给

plot http://www.milbo.org/doc/plotmo-randomforest-trees.png

您可以指定究竟哪些变量，变量对开始使用plotmo的ALL1，ALL2，degree1和degree2参数绘图。其他示例在vignette for the plotmo package中。

Answer 2

使用pdp包。文中给出了例子：https://journal.r-project.org/archive/2017/RJ-2017-016/RJ-2017-016.pdf。