我有一个相对较小的数据集,包含〜100k个边和〜7000个节点。我正在尝试使用两种算法来查找我的数据集中的社区。我加入的边,并着手运行在这里实施的算法:http://perso.crans.org/aynaud/communities/#as-python-module在小数据集上的Python网络x内存错误
数据基本如下:
节点1,节点2
节点1被连接到节点2并且是无向图。
但程序只是运行了一下,然后给我一个内存错误。我知道它是有效的,因为我在一个小的数据集上测试了它,它能正常工作,但它给我一个内存错误。我对这些算法并不了解,但我的印象是,我拥有的数据集非常小,我正在个人家用计算机上运行它。这只是实现本身的一个问题,还是由于我的机器的限制?
除了在具有更多内存的服务器上运行它之外,您有没有想过如何让它工作(即另一种软件或算法)?
谢谢!
回溯:
Traceback (most recent call last):
File "<wingdb_compile>", line 65, in <module>
File "C:\Python27\lib\site-packages\networkx\drawing\layout.py", line 242, in fruchterman_reingold_layout
pos=_fruchterman_reingold(A,dim,pos_arr,fixed,iterations)
File "C:\Python27\lib\site-packages\networkx\drawing\layout.py", line 280, in _fruchterman_reingold
delta = np.zeros((pos.shape[0],pos.shape[0],pos.shape[1]),dtype=A.dtype)
MemoryError
追溯请。 – kristaps 2012-03-27 17:51:37
确定添加了追踪 – Paul 2012-03-27 18:04:14
@Paul:尝试绘制网络时似乎发生错误。如果您不需要绘制,请移除这些部分,再试一次,看看是否出现错误。 – Avaris 2012-03-27 20:49:46