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我有一个包含多个子文件夹的文件夹,每个子文件夹包含不同类型的文件,有时还包含一个名为 run.csv的文件。但是,CSV文件始终命名为run.csv,并且始终包含列ID,通道,索引等。解析来自多个文件夹的CSV文件
我知道如何解析CSV文件,但无法弄清楚如何遍历子文件夹并打印所有的id,lane和index列,而不需要所有CSV文件的头信息。为此,我应该理想地使用perl语言。
我有一个包含多个子文件夹的文件夹,每个子文件夹包含不同类型的文件,有时还包含一个名为 run.csv的文件。但是,CSV文件始终命名为run.csv,并且始终包含列ID,通道,索引等。解析来自多个文件夹的CSV文件
我知道如何解析CSV文件,但无法弄清楚如何遍历子文件夹并打印所有的id,lane和index列,而不需要所有CSV文件的头信息。为此,我应该理想地使用perl语言。
我想你想要的是glob
:
foreach my $csv_file (glob "/path/to/dir/*/run.csv") {
#process CSV.
}
但它可能你想File::Find::Rule
:
foreach my $file (File::Find::Rule -> name ('run.csv') -> in ("/path/to/dir")) {
print $file,"\n";
}
这的确大同小异,但递归。在这两种情况下,您都会获得当前目录的相对路径,因此可以直接将它传递给open
。
使用'File :: Find'? – TLP