如何在ggplot的纵坐标中绘制不规则数据的热图？

Question

假设我想绘制以下数据：

# First set of X coordinates 
x <- seq(0, 10, by = 0.2) 
# Angles from 0 to 90 degrees 
angles <- seq(0, 90, length.out = 10) 
# Convert to radian 
angles <- deg2rad(angles) 
# Create an empty data frame 
my.df <- data.frame() 
# For each angle, populate the data frame 
for (theta in angles) { 
    y <- sin(x + theta) 
    tmp <- data.frame(x = x, y = y, theta = as.factor(theta)) 
    my.df <- rbind(my.df, tmp) 
} 

x1 <- seq(0, 12, by = 0.3) 
y1 <- sin(x1 - 0.5) 
tmp <- data.frame(x = x1, y = y1, theta = as.factor(-0.5)) 
my.df <- rbind(my.df, tmp) 

ggplot(my.df, aes(x, y, color = theta)) + geom_line() 

这给了我一个很好的情节：

现在我想提请热图出这个数据集。有教程here和there这样做使用geom_tile来做到这一点。

所以，让我们试试：

# Convert the angle values from factors to numerics 
my.df$theta <- as.numeric(levels(my.df$theta))[my.df$theta] 
ggplot(my.df, aes(theta, x)) + geom_tile(aes(fill = y)) + scale_fill_gradient(low = "blue", high = "red") 

这并不工作，原因是我的X坐标不具有相同的步骤：

x <- seq(0, 10, by = 0.2) VS x1 <- seq(0, 12, by = 0.3)

但只要我使用相同的步骤x1 <- seq(0, 12, by = 0.2)，它的工作原理：

我现实生活中，我的数据集不定时间隔（这是实验数据），但我仍然需要将其显示为热图。我能怎么做？

Answer 1

您可以使用akima将函数内插到适合于热图图形的表单中。

library(akima) 
library(ggplot2) 
my.df.interp <- interp(x = my.df$theta, y = my.df$x, z = my.df$y, nx = 30, ny = 30) 
my.df.interp.xyz <- as.data.frame(interp2xyz(my.df.interp)) 
names(my.df.interp.xyz) <- c("theta", "x", "y") 

ggplot(my.df.interp.xyz, aes(x = theta, y = x, fill = y)) + geom_tile() + 
scale_fill_gradient(low = "blue", high = "red") 

如果您希望使用不同的分辨率，您可以更改nx和ny参数interp。

用ggplot2做的另一种方法是使用stat_summary_2d。

library(ggplot2) 
ggplot(my.df, aes(x = theta, y = x, z = y)) + stat_summary_2d(binwidth = 0.3) + 
scale_fill_gradient(low = "blue", high = "red")