删除文件名

Question

的中东我要删除的文件名看起来像下面的中间：

Wm-no-Bis.GAGATTCC-ATAGAGGC.L001.R1.001.fastq.trim.R2.fastq 
Pek-no-Bis.GAGATTCC-AGGCGAAG.L001.R1.001.fastq.trim.R1.fastq 

至获取

Wm-no-Bis.trim.R2.fastq 
Pek-no-Bis.trim.R1.fastq 

正如你所看到的文件的开头和结尾稍微变量。 我试图使用命名如下：

rename 's/.*.*.*.*.*.trim.//g' 
Wm-no-Bis.GAGATTCC-ATAGAGGC.L001.R1.001.fastq.trim.R2copy.fastq 

这会删除整个文件名，除了结束。 这个问题显然是我缺乏理解如何使用通配符。

Answer 1

您可以使用此命令rename：

rename -n 's/^([^.]+).*(\.trim\..*)$/$1$2/' *.fastq 

当你快乐输出然后取出-n选项（干运行）

Answer 2

尝试

rename 's/\.\w+-\w+\..{4}\.R.\.\d{3}\.fastq//g' 

source