在不同的文件中使用子进程python

Question

我有一个短脚本的问题，如果你能看一看就会很棒！

import os 
import subprocess 

root = "/Users/software/fmtomov1.0/remaker_lastplot/source_relocation/observed_arrivals_loc3d" 

def loop_loc3d(file_in): 
    """Loops loc3d over the source files""" 
    return subprocess.call (['loc3d'], shell=True) 

def relocation(): 
    for subdir, dirs, files in os.walk(root): 
     for file in files: 
      file_in = open(os.path.join(subdir, file), 'r') 
      return loop_loc3d(file_in) 

我觉得这个脚本很容易理解，它很简单。但是我没有得到想要的结果。我只需要'loc3d'来操作'observed_arrivals_loc3d'目录中存在的所有文件内容，这意味着我需要打开所有文件，这就是我实际完成的工作。事实上，如果我尝试在'打印文件'之后：

for subdir, dirs, files in os.walk(root) 

我会得到每个文件的名称。此外，如果我尝试后

file_in = open(os.path.join(subdir, file), 'r') 

一个“打印file_in”我得到这样的线，用于对文件：

<open file '/Users/software/fmtomov1.0/remaker_lastplot/source_relocation/observed_arrivals_loc3d/EVENT2580', mode 'r' at 0x78fe38> 

子已上只有一个文件单独测试，它的工作。

总的来说，我没有收到任何错误，只是-11，这对我来说毫无意义。 loc3d的输出应该完全不同。

那么代码对你来说看起来不错吗？有什么我失踪？任何建议？

感谢您的帮助！

Answer 1

刚刚发现loc3d，作为unutbu说，依赖于几个变量，并在特定的情况下，一个名为“observal_arrivals”我有每次从我的目录创建和删除。在Pythonic术语中，这意味着：

import os 
import shutil 
import subprocess 

def loop_loc3d(file_in): 
    """Loops loc3d over the source files""" 
    return subprocess.call(["loc3d"], shell=True) 

path = "/Users/software/fmtomo/remaker_lastplot/source_relocation" 
path2 = "/Users/Programming/working_directory/2test" 
new_file_name = 'observed_arrivals' 
def define_object_file(): 
    for filename in os.listdir("."): 
     file_in = os.rename (filename, new_file_name) # get the observal_arrivals file 
     file_in = shutil.copy ("/Users/simone/Programming/working_directory/2test/observed_arrivals", "/Users/software/fmtomo/remaker_lastplot/source_relocation") 
     os.chdir(path) # goes where loc3d is 
     loop_loc3d (file_in) 
     os.remove("/Users/software/fmtomo/remaker_lastplot/source_relocation/observed_arrivals") 
     os.remove ("/Users/Programming/working_directory/2test/observed_arrivals") 
     os.chdir(path2) 

现在，这是工作得很好，所以它应该回答我的问题。我想这很容易理解，它只是复制，改变目录和那种东西。

Answer 2

我假设你会从CLI调用loc3d filename。如果是这样，那么：

def loop_loc3d(filename): 
    """Loops loc3d over the source files""" 
    return subprocess.call (['loc3d',filename]) 

def relocation(): 
    for subdir, dirs, files in os.walk(root): 
     for file in files: 
      filename = os.path.join(subdir, file) 
      return loop_loc3d(filename) 

换句话说，不要自己打开的文件，让loc3d做到这一点。

Answer 3

当前您的重定位方法将在第一次迭代后返回（对于第一个文件）。你根本不需要返回。

def loop_loc3d(filename): 
    """Loops loc3d over the source files""" 
    return subprocess.call (['loc3d',filename]) 

def relocation(): 
    for subdir, dirs, files in os.walk(root): 
     for file in files: 
      filename = os.path.join(subdir, file) 
      loop_loc3d(filename) 

这只是其中一个问题。另一个涉及loc3d本身。尝试提供loc3d的完整路径。

Answer 4

-11退出代码可能意味着该命令被信号分段故障所杀死。 这是loc3d中的一个错误。行为良好的程序不应在任何用户输入中产生“分段错误”。

饲料loc3d只有它可以理解的文件。打印的文件名或使用subprocess.check_call()找出哪些文件，它不喜欢：

#!/usr/bin/env python 
import fnmatch 
import os 
import subprocess 

def loc3d_files(root): 
    for dirpath, dirs, files in os.walk(root, topdown=True): 
     # skip hidden directories 
     dirs[:] = [d for d in dirs if not d.startswith('.')] 
     # process only known files 
     for file in fnmatch.filter(files, "*some?pattern[0-9][0-9].[ch]"): 
      yield os.path.join(dirpath, file) 

for path in loc3d_files(root): 
    print path 
    subprocess.check_call(['loc3d', path]) # raise on any error