搜索包含除

-1

之外的任何字符的行

我正在使用ruby编写简单的DNA测序程序。我需要了解一个String是否有任何其他字符比ACTG。例如：搜索包含除

这是一个DNA密码子序列：ACTGCGTAG

这是一种AA序列：ACACLG，ACTG

我怎样才能做到像这样使用正则表达式？

感谢

请记住，不是每个人都熟悉的DNA和其序列。所以目前还不清楚预期产出是什么。 – HamZa

@HamZa当然，你是对的。任何包含'A'，'C'，'T'，'G'（在我的情况下）字符的字符串都是AA序列，因此是一个*有效的*字符串。顺序无关紧要，对于无效字符串可能是'GTACACACA'，对于有效字符串可能是'ACLTG'。 –

'string.include？（'ACTG'）' – Kris

如果我理解正确的话，

!str.match(/[^ACTG]/)应该解决您的问题。

例如

!"ACTGCGTAG".match(/[^ACTG]/)返回true。

而

!"ACACLG".match(/[^ACTG]/)回报false

2014-04-15 11:22:09 Saurabh

是的，这是正确的。谢谢 –

你可以做到这一点是：

[^ACGT]与m标签启用

2014-04-15 11:05:40 sshashank124

看来'ACGT'是一个__sequence__。这不会检测到“ACGTC”。 – devnull

没有其实是正确的。 –

回答