如何创建多行的箱线图？

我有1200个探针（行中）的数据框和两组数组，每组九列。前九栏命名为“正面”，后九栏命名为“负面”。我想通过使用盒图选择12个随机探针来表明表达正常。我的代码如下：如何创建多行的箱线图？

f<-c(rep("positive", 9), rep("negative", 9)) 
for(i in seq(from=1, to=1200, by=10)){ 
    boxplot(probes[i]~f,col="lightblue",main="Expression of genes studied Cells") 
}

但我收到以下错误：

Error in model.frame.default(formula = probes[i] ~ f) : 
    variable lengths differ (found for 'f')

如果我用箱形图的正常工作一个探头。我得到两个箱子，一个对应于“积极的”，另一个为“负面”：

f<-c(rep("positive", 9), rep("negative", 9)) 
genex<-as.numeric(dat.fp.labeled["NM_139321.1_psr1_at",]) 
boxplot(genex~f,col="lightblue",main="Expression of NM_139321.1_psr1_at samples")

来源

2013-08-17 user2649495

你能提供关于结构的更多细节你的数据？探测器是一个矢量吗？如果没有，那么你在调用'boxplot'时会错误地编制索引。此外，您当前的代码将创建120个箱型图，但我不认为这就是您想要做的... – Thomas

可能重复[按两个条件分组的多个箱型]（http://stackoverflow.com/questions/13124827/多箱线形 - 按两条件分组） – Metrics

它是一个数据帧，包含1200行和18列.18列有两种类型。前9名被命名为“正面”，后9名被命名为“负面”。如果我为单排而言，它可以很好地生成两个框，每个框用于正面和负面。代码：是：f <-c（rep（“positive”，9），rep（“negative”，9）） genex <-as.numeric（dat.fp.labeled [“NM_139321.1_psr1_at”，]）boxplot（genex〜f，col =“lightblue”，main =“NM_139321.1_psr1_at样本的表达式”） – user2649495

此，我认为，这是你想要什么：

set.seed(1) 
probes <- data.frame(matrix(rnorm(1200*18),ncol=18)) 
f<-c(rep("positive", 9), rep("negative", 9)) 
myrows <- sample(1:1200,12,FALSE) 
boxplot(unlist(probes[myrows[1],])~f) # first plot 
for(i in myrows){ 
    boxplot(unlist(probes[i,])~f) 
    Sys.sleep(1) # wait for each plot for 1 sec 
}

来源

2013-08-17 13:05:00 Thomas

嗨托马斯，感谢您的示例代码。我有一个问题：我会在哪里放置我的数据？在您的代码中，您正在创建数据框，探针。让我们说我的数据在名为data.fp的数据框中，我可以在哪里放入代码？谢谢 – user2649495

在for循环中，它表示“unlist（probes [i，]）''。如果你把它改成'unlist（data.fp [i，]）'，我想你应该得到预期的结果。 – Thomas

如何创建多行的箱线图？

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