R中的多核处理Windows 7 x64

Question

R新手，我需要使用spatstat包运行一些点模式分析。

由于我的数据非常大，spatstat只使用四个内核中的一个内核，所以我想知道是否可以加速多线程处理过程。

我发现this paper，它提供了一个软件包，它可以转换spatstat的功能以用于并行环境。根据这篇论文，我首先需要安装Rmpi。

第一次，我遇到了msmpi.dll丢失的问题。安装a windows package后，我能RMPI装入R.

在这一点上，我觉得有什么不对的地方，因为它似乎并不认为RMPI正常工作：

> library(Rmpi) 
> mpi.spawn.Rslaves(nslaves=4) 
Erreur dans mpi.comm.spawn(slave = system.file("Rslaves64.cmd", package = "Rmpi"), : 
Other MPI error, error stack: 
MPI_Comm_spawn(106)..........: MPI_Comm_spawn(cmd="C:/Users/ddeltenre/Documents/R/win-  
library/3.0/Rmpi/Rslaves64.cmd", argv=0x000000000EC70C90, maxprocs=4, MPI_INFO_NULL, 
root=0, MPI_COMM_SELF, intercomm=0x000000000F44A878, errors=0x000000000E729AA8) failed 
MPID_Comm_spawn_multiple(314): Function not implemented 

我的问题是因此以下内容：

1. 最重要的，即使我设法让RMPI工作，岂不是parspatstat 会工作，或做在Linux所有的东西 安装将是更容易？

2. Rmpi​​是否真的被设计成允许多核处理？

3. 是否可以在Windows 7 x64上使用Rmpi？

4. 安装Windows软件包之前，我跟着这个教程 （www.stats.uwo.ca/faculty/yu/Rmpi/windows.htm），以为那就是 要走的路。虽然我删除了MPICH（我没有解决问题）， 它可以影响Rmpi的行为吗？

您的帮助非常感谢

Answer 1

看来，MPICH2是推荐的Windows MPI分布，所以我也建议你使用它。要安装并运行所有内容可能并不容易，但如果您使用推荐的分发版本，从别人那里获得帮助会容易得多。

我希望你能在Windows上使用MPICH2/Rmpi​​获得“parspatstat”，它可以让你使用多个内核，但可能很难。如果您有选择，我肯定会推荐使用Linux，尤其是基于Debian的发行版，它对Rmpi有极好的支持。

尽管MPI主要面向多机器（如群集）使用，但大多数实现都支持在多核机器上运行。尽管如此，在花费很长时间试图在Windows上工作之前，可能需要在Linux机器上测试“parspatstat”。