我怎样才能得到这个查找命令将结果返回到变量?它在命令行上工作,但在脚本中不是那么多。如何在脚本中将find结果返回给变量?
BZIP_FILES="$(find /dev/runs/sample -maxdepth 1 -type f -name \"*L*_R1*.fastq.gz\" | sort | head -1)"
目录的/ dev /运行/样品
17-ABCC7-A-02-00-R_GAATCTTCGC_L001_R1_001.fastq.gz
17-ABCC7-A-02-00-R_GAATCTTCGC_L002_R1_001.fastq.gz
17-ABCC7-A-02-00-R_GAATCTTCGC_L003_R1_001.fastq.gz
17-ABCC7-A-02-00-R_GAATCTTCGC_L004_R1_001.fastq.gz
bak
fusion
SampleSheet.csv
结果应该是17 ABCC7-A-02-00-R_GAATCTTCGC_L001_R1_001.fastq.gz
所以.. 1)什么结果做你得到? 2)为什么你要调用'gzip'文件'BZIP_FILES'? –
变量名无效且结果为空 – millsofmn
删除引号前的\ BZIP_FILES =“$(find/dev/runs/sample -maxdepth 1 -type f -name”* L * _R1 * .fastq.gz “| sort | head -1)”' – Tamar