2016-04-14 47 views
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“a”是一个数据帧。用ggplot2连接不同线型的点

set.seed(2) 
a<-data.frame(group= rep(c("A","B","C"),each=4),factor=rep(c(1,1,2,2),3), 
       model=rep(c("old","new"),6),mean=runif(12),sd=runif(12)/10) 

>a 
      group factor model  mean   sd 
     1  A  1 old 0.1848823 0.076051331 
     2  A  1 new 0.7023740 0.018082010 
     3  A  2 old 0.5733263 0.040528218 
     4  A  2 new 0.1680519 0.085354845 
     5  B  1 old 0.9438393 0.097639849 
     6  B  1 new 0.9434750 0.022582546 
     7  B  2 old 0.1291590 0.044480923 
     8  B  2 new 0.8334488 0.007497942 
     9  C  1 old 0.4680185 0.066189876 
     10  C  1 new 0.5499837 0.038754954 
     11  C  2 old 0.5526741 0.083688918 
     12  C  2 new 0.2388948 0.015050144 

我想用ggplot2绘制一个“mean±sd”线图。 我的目的是绘制一张图片(x轴是“group”,y轴是“mean±sd”,不同的“factor”应该有不同的颜色,不同的“model”应该有不同的连接线型虚线,新的模式是实线))

我使用以下代码:

library("ggplot2") 
pd <- position_dodge(0.1) #The errorbars overlapped, so use position_dodge to move 
          #them horizontally 
plot<-ggplot(a, aes(x=group, y=mean, colour=as.factor(factor), linetype=model)) + 
    geom_errorbar(aes(ymin=mean-sd, ymax=mean+sd), width=.1, position=pd) + 
    geom_point(position=pd, size=3, shape=21, fill="white") + # 21 is filled circle 
    xlab("Groups") + 
    ylab("Power") + 
    geom_line(position=pd) + 
    scale_linetype_manual(values = c(new = "solid", old = "dashed")) 

enter image description here

但“平均值±sd”应该都是实线,并且应该被添加点之间连接。其实我想它是这样的:

enter image description here 你能给我一些建议,谢谢!

回答

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我建议增加一个新的分组变量:

a$group2 <- paste(a$factor, a$model, sep="_") 

然后从ggplot()删除linetype和修改geom_line()

ggplot(a, aes(x = group, y = mean, colour = as.factor(factor))) + 
     geom_errorbar(aes(ymin = mean-sd, ymax = mean+sd), 
        width = .1, position = pd) + 
     geom_point(position = pd, size = 3, shape = 21, fill = "white") + 
     xlab("Groups") + 
     ylab("Power") + 
     geom_line(aes(x = group, y = mean, colour = as.factor(factor), 
        group = group2, linetype = model)) + 
     scale_linetype_manual(values = c(new = "solid", old = "dashed")) 

enter image description here

+1

太谢谢你了!看起来很好!但是有一个问题:同一种颜色的新模型和旧模型是重叠的,你可以帮助处理这个问题,谢谢! @beetroot – lightsnail

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例如,在B组中,两个红色的“mean±sd”重叠,最好不要将它们排列在同一个x轴上,更小的间隙会更好。 – lightsnail

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如果我设置“pd < - position_dodge(1)”,那么使用你的代码的格雷就会变得有点奇怪。 @beetroot – lightsnail