使用bioperl从GFF3数据库获取属性值

Question

我已经使用BioPerl存储对象（BIO：DB：SeqFeature：Store）创建了GFF3数据库 我自己从Blastx结果创建了GFF3文件并创建了一系列我自己的标记作为属性。现在我会从BioPerl为我创建的数据库中获取这个值....

我该怎么做？

请帮忙！ 非常感谢。

Answer 1

我发现存在函数在包BIO::SeqFeature::Generic中执行此操作。 最有用的是get_tag_values，它返回一个数组，其中每个值都包含在具有输入中给定的特定标记的属性中！

用法：

my @values= $feature->get_tag_values('go'); 

再见大家！