2015-07-21 40 views
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需要解决方案,非常感谢您的帮助。在栅格列表上执行循环

在下面的代码中,我创建了三个栅格。然后我在这个光栅上创建一个点位置的随机number,我正在接收一个三个矩阵的列表,这些矩阵的坐标是那些称为samples的随机位置。然后我将这些位置和样本栅格值接收到samplevalues

我想改变的是我想创建一组100,150,200和250个随机点位置(numberv)。因此,在生成这些位置并接收到位置列表之后,每个栅格将被采样length(numberv)次(在这种情况下为4次)。因为我有三个栅格,那么我想要获得一个列表,其中包含从我的三个栅格中抽取100个样本值的第一个元素,第二个元素抽样的栅格值为150次,等等。该列表将包含length(numberv)个元素。然后,我将使用这些位置来获取这些位置的栅格值。

我只用一个样本粘贴了一个简单案例的干净代码(使用了1个元素矢量number),希望它有帮助。

y <- matrix(1:300,100,3) 
mv <- c(1,2,3) 
rep = 200 

valuematrix <- vector("list",ncol(y)) 

for (i in 1:ncol(y)) { 
     newmatrix <- replicate(rep,y[,i]) 
     valuematrix[[i]] <- newmatrix 
} 

library(sp) 
library(raster) 

rasters <- setNames(lapply(valuematrix, function(x) raster(x)), 
        paste0('raster',1:length(mv))) 

# Create a loop that will sample the rasters 

library(dismo) 

number = 100      # current number for random sample points number 
numberv = c(100,150,200,250)  # sample number vector i want to use 

# samples below will hold only coordinate values: 
samples <- setNames(lapply(rasters, function(x) randomPoints(raster(x), 
                  n=number)), 
        paste0('sample',1:length(mv))) 

samplevalues <- vector("list",ncol(y)) 

for (i in 1:ncol(y)) { 
     samplevalues[[i]] <- data.frame(samples[[i]],extract(rasters[[i]], 
                  samples[[i]])) 
} 

回答

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这是行吗?

# Function to sample using a given number (returns list of three) 
sample.number <- function(x) { 
    rps <- lapply(rasters, function(y) randomPoints(raster(y),n=x)) 
    setNames(rps,paste0('sample',1:length(mv))) 
} 

# Apply sample.number() to your numberv list 
sample.set <- lapply(numberv,sample.number) 

# Function to extract values from a given sample 
sample.extract <- function(x) { 
    lapply(1:length(x),function(y) data.frame(x[[y]],extract(rasters[[y]],x[[y]]))) 
} 

# Apply sample.extract() to the set of samples (returns list of four lists) 
sample.values <- lapply(sample.set,sample.extract) 

# Access sample 1 of number 200 
summary(sample.values[[3]][[1]]) 
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非常感谢,这正是我需要的:) – MIH

+1

不客气。 –

+0

如何重构sample.extract函数,因此我们将考虑使用sample.set [[1]] [2]从rasters [1]中获取栅格值。然后sample.set [[1]] [3]并从栅格[2]中获取栅格值。结果将是一个4个元素的列表,每个元素将是一个两个项目的列表。我在这里发布新的问题http://stackoverflow.com/questions/31585708/sampling-with-list-of-rasters-and-locations-using-function-in-r – MIH