我有一个程序可以运行流感A中一种蛋白质的氨基酸序列列表,我正在分析这个蛋白质并找到627位的氨基酸在每个蛋白质的FASTA文件中的每个氨基酸序列中。Python 2.7嵌套If语句在打印数组位置后不会打印字符串文字
我的代码是这样的
with open(file, "r") as source:
for heading_and_lines in group_by_heading(source):
heading= heading_and_lines[0]
lines= heading_and_lines[1:]
lines = ''.join(lines)
if lines[627-1] == 'K':
print "---------------MUTATION BELOW--------------"
print heading
print lines[627-1]
#print "-------------------------------------------"
print "end of file"
但我的代码不工作这样
with open(file, "r") as source:
for heading_and_lines in group_by_heading(source):
heading= heading_and_lines[0]
lines= heading_and_lines[1:]
lines = ''.join(lines)
if lines[627-1] == 'K':
print "---------------MUTATION BELOW--------------"
print heading
print lines[627-1]
print "-------------------------------------------"
print "end of file"
出于某种原因,打印,我发现返回一个错误的突变下方的线,和意外缩进。看到我想要每条突变下面的行,就像上面的行一样,所以我可以清楚地组织突变。任何你认为下面的打印声明不起作用的原因?
对不起,如果这听起来很混乱,并一如既往感谢您的时间。
检查标签和间距。如果你的程序中有两个,它会中断。 – TigerhawkT3
当我把它拉回来时,它会在每个菌株的下面打印一条线,当我只想在下面打印具有赖氨酸突变的菌株(AKA氨基酸'K'匹配) – SweetJD14
Darn。我只是检查了所有的空格,并且在打印位置[627-1]处的氨基酸之后,它不会让我打印任何字符串文字。出于某种原因,它总是说意想不到的缩进。 – SweetJD14