如何获取NIfTi对象中的图像数量？ （nibabel）

Question

我有一个从dicom文件目录生成的Nifti对象。 看来，Nifti应该知道它拥有多少帧，但我可以在标题信息中找到的就是形状。问题是，形状有时（num_images，x，y）和有时（x，y，num_images）。

我发现唯一的nibabel函数与Ecat库相关。我不熟悉ecat格式，但我想让我的方法适用于任何nii文件。我正在与nibabel图书馆合作。

有没有办法检索NIFTI文件中的图像数量？

Answer 1

我猜你在看fMRI，DTI或ASL数据。

假设你的4D nii堆栈被称为'data.nii'。

刚进入该目录，并做到：

mri = nib.load('data.nii')

mri.shape

你看到的第四个元素将是卷数。你可以这样访问它：mri.shape[3]如果你需要它在某种程度上用于你的程序。

这对我一直工作。如果你的数据以不一致的方向“叠加”，你将不得不变得幻想。

您可以包含基于图像维度的检查。例如，如果您知道您的图像是128x128x128，那么您可以继续并获取mri.shape不是128的任何一个元素，但是由于几个原因，此方法并不理想。