如果我有一个像在numpy中实例化结构化dtype的语法是什么?
foo = dtype([('chrom1', '<f4', (100,)), ('chrom2', '<f4', (13,))])
一个D型我怎样才能创建一个D类的一个实例,作为一个标量。
背景,如果有一个更好的办法:
我想直接有效的标量代表映射阵列在基因组的基础上,通过染色体染色体。我不想要这些基因组数组的数组,每一个都只是一个结构化的标量集,我想通过名称/位置来引用,并且能够添加/减去/ etc。
看来,dtype.type()也许是前进的路径,但我还没有找到有用的文档,以正确调用此功能呢。
所以假设我有:
chrom1_array = numpy.arange(100)
chrom2_array = numpy.arange(13)
genomic_array = foo.type([chrom1_array, chrom2_array])
最后一行是不对的,但希望它传达什么我目前尝试。
这是一个可怕的想法?如果是这样,什么是正确的想法?如果没有,那么实施它的正确方法是什么?
这类作品,但可怕的:
bar = np.zeros(1, dtype=[('chrom1', 'f4', 100), ('chrom2', 'f4', 13)])[0]
我认为你可以得到的最接近的是 “标量阵列”:'栏= NP。数组((chrom1_array,chrom2_array),dtype = foo)'。 'bar'是一个形状为'()'的数组。 – 2014-11-05 00:21:00
这些“genomic_array”有多少?你在做什么样的数学运算?到目前为止,您的描述不适合使用结构化数组。多维数组是您高效运算的最佳选择,而类/对象最适合定义复杂对象。 – hpaulj 2014-11-05 05:47:13