瞬时和扩展数据的文件夹中的R包装

在本文档中，R表明，原始数据文件（未RDATA也不RDA）应该被放置在inst/extdata/瞬时和扩展数据的文件夹中的R包装

从第一段中：http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-exts.html#Data-in-packages

数据子目录用于数据文件，要么通过延迟加载或使用数据（）加载。（选择由在说明文件中所做的“LazyData”字段：默认为不这样做如此）。它不应该被用于由包，所需的其他数据文件，该公约已经成长起来使用目录inst/extdata这样的文件。

所以，我提出我的所有原始数据到这个文件夹，但是当我建立和重新加载包，然后尝试用（例如）访问一个函数的数据：

read.csv(file=paste(path.package("my_package"),"/inst/extdata/my_raw_data.csv",sep="")) 
# .path.package is now path.package in R 3.0+

我收到“无法打开文件”错误。

但是，它看起来像有一个包目录名为/extdata与文件夹它（生成后安装）。 /inst文件夹中发生了什么？

是否一切都在/文件夹研究所将被推入到包装的/？

来源

2012-11-19 Brandon Bertelsen

/inst文件夹中的所有文件夹都会在软件包的顶层目录中找到自己的位置。基本上，/ inst中的所有内容都会放在最上面的目录中，因此任何文件夹都会以自己的文件夹结尾。但是，这只是从经验，我无法找到R exts中的任何东西，解释这... – Dason

我只是补充说，我更喜欢file.path创建文件的路径 – Dason

你们都非常亲密，基本上有这个。从写作R附加软件'的正式参考是：

1.1.3包装子目录

[...]

的inst子目录中的内容将被递归复制到安装目录。的inst子目录不应与那些由R使用干扰（目前，R，data，demo， exec，libs，man，help，html和Meta，和早期版本使用latex，R-ex）。之后src 建所以来安装其Makefile可以创建文件inst的复制发生。此前 [R 2.12.2，该文件安装在与包源的权限POSIX平台，所以应小心，以确保这些都没有太多限制：R CMD build将作适当调整。要排除被安装的文件，可以在顶级源目录中的文件.Rinstignore指定排除模式的列表。这些模式应该是类Perl的常规表达式（对于精确细节，请参阅R中的regexp的帮助），每行一个，与文件和目录路径匹配（10），例如，例如。 doc/.*[.]png$将排除基于的（小写）扩展在inst/doc所有PNG文件。

来源

2012-11-19 22:46:01

感谢您。我正试图在文档中搜索“inst”。 –

比使用file.path是使用system.file更加有用。一旦安装你的包，你可以抓住你的文件，像这样：

fpath <- system.file("extdata", "my_raw_data.csv", package="my_package")

fpath现在将对您的高清文件的绝对路径。

来源

2012-11-19 22:49:21

+1有用，谢谢。 –

瞬时和扩展数据的文件夹中的R包装

回答

相关问题