使用R解压缩gz文件

我以前使用?unzip来使用R获取压缩文件的内容。这段时间，我很难从.gz文件中提取文件，该文件可以从here中找到。使用R解压缩gz文件

我试过?gzfile和?gzcon，但一直没有得到它的工作。任何帮助你可以提供将不胜感激。

2011-04-23 Btibert3

如果你真的想解压缩文件，只需使用untar功能，不支持gzip的。例如为：

untar('chadwick-0.5.3.tar.gz')

来源

2011-04-24 11:57:39 daroczig

这里是一个工作的例子，可以帮助说明什么gzfile()和gzcon()是

R> foo <- data.frame(a=LETTERS[1:3], b=rnorm(3)) 
R> foo 
    a  b 
1 A 0.586882 
2 B 0.218608 
3 C 1.290776 
R> write.table(foo, file="/tmp/foo.csv") 
R> system("gzip /tmp/foo.csv")    # being very explicit

现在，该文件被写入，而不是隐式使用的file()，使用gzfile()：

R> read.table(gzfile("/tmp/foo.csv.gz")) 
    a  b 
1 A 0.586882 
2 B 0.218608 
3 C 1.290776 
R>

您指出的文件是一个压缩的tar归档文件，据我所知，R本身没有tar归档文件的接口。这些通常用于分发源代码 - 例如R包和R源。

来源

2011-04-23 13:51:52

是否有可能与'FREAD {data.table}'这样做呢？我到目前为止尝试没有成功 – 2016-04-25 22:38:31

我不这么认为。检查'fread'文档。 – 2016-04-26 00:51:40

'fread（paste0（“zcat <”，PATH_TO_FILE））' – 2016-06-10 15:55:21

http://blog.revolutionanalytics.com/2009/12/r-tip-save-time-and-space-by-compressing-data-files.html

ř加入透明减压某些种压缩文件中的最新版本（2.10）。如果您使用bzip2，xvz或gzip压缩文件，则可以将它们读入R，就像它们是纯文本文件一样。你应该有适当的文件扩展名。

命令

myData <- read.table('myFile.gz')

#gzip压缩文件有一个 “GZ” 扩展

将工作就像 'myFile.gz' 中的原始文本文件。

来源

2013-09-24 17:36:15 WCC

除非指定colClasses参数，否则它可以工作。如果你添加 myData < - read.table（'myFile.gz'，colClasses = c（“character”，“integer”））然后你会得到一个错误（从R 3.2.0开始）。废话。 – Met 2015-06-12 16:58:51

要取消GZ R中一个文件，你可以做

library(R.utils) 
gunzip("file.gz")

来源

2015-05-09 19:25:39 RobertH

那就是我在找的东西。注意：'注意：默认的（remove = TRUE）行为是在输出文件被完全创建并关闭之后，输入文件被删除。“ - 见'？gunzip' – Rentrop 2016-12-27 10:33:50

哇，这似乎是错误的。 – wordsforthewise 2017-03-01 22:51:58

使用R解压缩gz文件

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