bgzip目录中的所有VCF文件？

Question

所以我一直在尝试对100个VCF文件进行bgzip并行处理，但是虽然作业已经提交并且文件被创建，但肯定有错误。

到目前为止，我一直在努力：

$for file in *.vcf 

> do 

> bsub /foo/bar/bgzip $file 

>> $file.gz 

什么是做这种正确的方法是什么？

提前致谢！

Answer 1

如果像我websearches建议，bgzip的工作方式为gzip一样，你不指定输出文件：

for f in *.vcf; do 
    bsub bgzip "$f" 
done 

你也应该用双引号变量的情况下，您的文件名有空间在其中。