R和并行化

在并行处理中，我是一个新手，我想提供一些建议。R和并行化

我的[R方案具有结构如下：

Data reading 
Preliminary calculations 

vector1 <- array(NA,sim=nsim) 
vector2 <- array(NA,sim=nsim) 
for (i in 1:nsim) 
{ 
some calculations involving some global variables and 
whose results are saved in vector1 and vector2 
} 
Final calculations using vector1 and vector2

这个循环是非常耗时的，我想知道其中R包可以提供我并行化的最佳途径。你有什么想法吗？提前致谢。

来源

2012-10-30 Ludo

该循环很容易重写以使用'foreach'软件包。在Linux上，我使用'foreach'和'doMC'后台有很好的经验。请参阅[本简介]（http://cran.r-project.org/web/packages/doMC/vignettes/gettingstartedMC.pdf）。 – Roland

但是，我怀疑这个循环可以被重写，效率更高。 – Roland

你能重写一个lapply调用的循环吗？如果是的话，你可以使用parLapply（从包并行）。 –

这是一个类似的问题： How to make R use all processors? 它比你更模糊一点，所以是正确答案，但它可能会有所帮助

它看起来像你将不得不下载某种包，如 http://cran.r-project.org/web/packages/multicore/index.html 或http://cran.r-project.org/web/packages/doSNOW/index.html

啊，对晚会有点迟。他们是对的，这个foreach看起来非常有用。

来源

2012-10-30 11:32:28

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