解析多维名单,我有以下的文本文件 - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Class/FieldGuide/BLOSUM62.txt形成与蟒蛇
我需要一个Python代码给我矩阵的特定条目。我使用多维列表,并希望不使用python中的numpy库。我的意图是在列表内部形成列表,其中外(主)列表包含矩阵的行,而内列表包含矩阵的单元格。
我使用以下代码 -
handle=open(fname)
li=[]
matrix=[]
for line in handle:
if not line.startswith('#'):
a=line.split()
for i in a:
li.append(i)
matrix.append(li)
print matrix
然而,这只是返回其中每个元素的矩阵的一个单元的一名维列表。我迷失于如何解决这个问题。输出应该是这个形式 -
[['A', 'R', 'N', 'D', 'C', 'Q', 'E', 'G', 'H', 'I', 'L', 'K', 'M', 'F', 'P', 'S', 'T', 'W', 'Y', 'V', 'B', 'Z', 'X', '*'],
['A', '4', '-1', '-2', '-2', '0', '-1', '-1', '0', '-2', '-1', '-1', '-1', '-1', '-2', '-1', '1', '0', '-3', '-2', '0', '-2', '-1', '0', '-4']]
这只是给了我一吨的垃圾产量。我使用内部循环的意图是第一个列表应该包含单元格元素,第二个列表应该是每行的这些单元格元素的列表。 –
我想我不明白你想要什么。你能编辑问题来显示所需的输出吗? – Blckknght
这是否使问题更清晰? @Blckknght –