GNU并行使用两个参数

Question

我有一个称为形式的$hosts_string变量C-shell脚本：

host1,host2,...,hostN 

我也有一个变量被称为形式的$chrs_string：

chr1,chr2,...,chrM 

我也有一个名为$inputFn的变量，它指定了我需要处理的文本文件。

我想要做的是让每个主机在$chrs_string的每个成员上运行一个名为doStuff的命令，将$inputFn作为输入文件名参数。

我试过如下：

parallel -S $hosts_string 'doStuff {1} {2} > {1}' ::: {$chrs_string} ::: {$inputFn} 

如果一切正常，应通过chrM创建文件chr1从命令doStuff输出，但我什么也没得到。并行完成时不发出错误，但没有输出。

如果我不使用parallel，命令本身可以正常工作，所以它不是命令，但我如何指定parallel的参数。

为了证实这一点，我试过如下：

parallel -S $hosts_string 'echo {1} {2} > {1}' ::: {$chrs_string} ::: {$inputFn} 

如果这是工作，并$inputFn是（例如）/foo/bar，那么我会得到（例如）一个名为chr1，包含字符串：

chr1 /foo/bar 

如何调整我的parallel命令，使其遍历的$chrs_string和每个组合正确吗？

Answer 1

你就近了。你忘记:::是不一样的::::

parallel -S $hosts_string 'echo {1} {2} > {1}' ::: {$chrs_string} :::: {$inputFn} 

如果你只是想在你只需做回声文件名：

parallel -S $hosts_string echo '{1}' {$inputFn} '> {1}' ::: {$chrs_string}