增加堆栈大小

我正在做巨大数组的计算，对于这些计算中的一些，我需要增加堆栈大小！在我的〜/ .bashrc中将堆栈大小设置为无限制（ulimit -s unlimited）有什么不利吗？增加堆栈大小

该程序使用Fortran编写（F77 & F90）并与MPI并行化。我的一些阵列有超过2E7条目，当我使用MPI的少量内核时，它会与segmentation fault崩溃。

数组大小保持在整个计算同样，因此我设置好的他们修正值：

real   :: p(200,200,400) 
integer  :: ib,ie,jb,je,kb,ke 
... 
ib=1;ie=199 
jb=2;je=198 
kb=2;ke=398 
call SOLVE_POI_EQ(rank,p(ib:ie,jb:je,kb:ke),R)

2015-08-28 chi86

你正在运行什么样的软件？在哪种编程语言？你在编码吗？你能否显示一些源代码（所以**编辑你的问题**以改善它）？ –

Fortran77，Fortran90，Fortran2006？显示处理（并分配）巨大数组的实际代码。 –

将堆栈大小设置为无限可能不会对您有所帮助。您正在堆栈中分配64MB的大块，并且可能不会从顶部填充，而是从底部填充。

这很重要，因为操作系统随着您的增长而增长。只要它检测到堆栈段下方的页面错误，就会认为您需要更多空间，并静静地插入新页面。尽管如此，你的地址空间中这个触发区的大小是有限的，我怀疑它大于64 MB。由于您的索引变量可能位于堆栈之下的数组之下，因此访问它们已经导致64 MB跳跃，从而导致您的进程崩溃。

只要让你的数组allocatable，添加相应的allocate()声明，你应该没问题。

2015-08-31 05:36:17 cmaster

我一直认为在运行时数组大小发生变化时会使用'allocatable'数组吗？我从一开始就修好了，在整个计算过程中保持不变！ – chi86

您可以使用'allocatable'来创建动态大小的数组，但它也可以避免大的堆栈分配。一个可分配数组总是分配在没有堆栈限制的堆上。而'allocate（）'语句不会抱怨，如果你传递一个编译时间常量;-) – cmaster

好吧，这是有道理的，那么我会这样做！谢谢 – chi86

堆栈大小是从来没有真正无限的，所以你还是会有一些故障。而且你的代码仍然不能移植到小型（或普通大小）堆栈的Linux系统上。

顺便说一句，你应该说明你正在运行哪种程序，显示一些源代码。

如果使用C++编码，使用标准containers应该会有很大的帮助（关于实际的堆栈消耗）。例如，本地（已分配堆栈）std::vector<int> v(10000);（而不是int v[10000];）将其数据分配到堆上（并且在从定义它的块中退出时由析构函数释放）

改进程序会好得多以避免过多的堆栈消耗。需要大量的堆栈空间实际上是一个你应该尝试纠正的错误。典型的经验法则是让01小于几千字节（因此在堆上分配任何更大的数据）。

你也许还可以考虑使用Boehm conservative garbage collector：你会使用GC_MALLOC代替malloc（你会堆上分配使用GC_MALLOC大数据结构），但你不会费心去free你（GC-堆allcoated）数据。

2015-08-28 05:23:02

我编辑了我的问题！我的代码最重要的是减少计算时间。数组总是保持相同的大小，因此我将它设置为固定值！ – chi86

分配堆中的数组不应该改变CPU的时间。 –

好吧，但我没有看到优势，如果我创建它们时将其设置为固定值。或者是'p（ib：ie，jb：je，kb：ke）'这个问题？ – chi86

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