如何在R中执行p.adjust？

我有一个数据帧p.value s，我想调整p.values。我用这个commad：如何在R中执行p.adjust？

Padjust = p.adjust(pvalues, "fdr")

pvalues是缺失值和fdr我的数据帧是，我想使用的方法。然而，I'm得到以下错误：

Error in p.adjust(pvalues, "fdr") : 
(list) object cannot be coerced to type 'double

2013-03-12 Telma_7919

p.adjust'的'第一个参数是P值的矢量，而不是一个数据帧... – alexwhan 2013-03-12 11:02:07

如果您data.frame包含：你可以然后通过调整p值添加到您的数据帧所有的p.values，也许你想使用sapply（）？ 'sapply（pvalues，p.adjust，method =“fdr”）' – 2013-03-12 11:05:07

的p.adjust第一个参数应该是一个载体，见

?p.adjust

在特定情况下，你需要从你的数据帧中选择值并把它们传递给函数，那么这样的：

p.adjust(pvalues$p.values, "fdr")

如果列名是p.values。

pvalues$adjust = p.adjust(pvalues$p.values, "fdr")

2013-03-12 11:04:04 csgillespie

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