将excel文件读入Shiny

Question

我是Shiny的新手，正尝试使用Excel文件中的数据运行应用程序。似乎应该很简单，但无法弄清楚。还有更复杂的任务（交互式上传文件，指定列，文件位置等）的负载信息 - 但我想要的是一个应用程序，它使用来自加载在后台的单个Excel文件中的数据。

之前已经提出过类似问题（Uploading csv file to shinyApps.io和R Shiny read csv file），但我没有从他们那里得到满意的答案。

我把我的excel文件保存在与app.R文件相同的目录下，名为'data'的文件夹中。我读入到我的剧本的server部分是这样的：

server <- function(input, output){ 
    # Read in data 
    myDF <- read_excel('data/MyShinyData.xlsx') 

当我运行app.R文件来测试应用程序，它工作正常。但是，当我使用shinyapps::deployApp('pathToWorkingDirectory')将其发布到Shiny网站时，我得到的应用程序的灰色版本没有交互性。如果我模拟app.R文件中的数据（excel文件就是这个模拟数据，写入excell与write.xlsx），该应用程序还会向网站发布罚款 - 只有当我拿出用于模拟数据的代码时并用它停止工作的read_excel命令替换它。我也尝试使用.csv文件而不是.xlsx，但同样的问题。

我已经从下面的app.R文件复制了完整的代码。

我在做什么错？谢谢你的帮助。

library('ggplot2') 
library('shiny') 
library('psych') 
library('readxl') 

#=============== 
#This code makes a histogram, a coplot, and a prediction for species richness ('SpNat') given Forest cover ('NBT'). 
#=============== 

m1 <- lm(SpNat ~ NBT, data=myDF) #For prediction. best to create all non-reactive [ie non-updating] code outside the app, so it doesn't have to run every time. 

#========== 
# ui section 
#========== 

ui <- fluidPage(

    ### MAKING A TITLE 
    titlePanel("Dashboard based on excel data"), 

    ### DIVIDING INPUTS TO SIDEBAR VS MAIN PANELS: 
    sidebarLayout(

    sidebarPanel(               #everything nested in here will go in sidebar 
    #dropdown input for coplot: 
    tags$h3('Select coplot variables'), #heading 
    selectInput(inputId='choiceX', label='Choose X variable', 
       choices=c('Species richness'='SpNat', 'Forest cover'='NBT', 'Pest control'='PC')), #***Choices are concatenated text strings. 
    selectInput(inputId='choiceY', label='Choose Y variable', 
       choices=c('Species richness'='SpNat', 'Forest cover'='NBT', 'Pest control'='PC')), 
    selectInput(inputId='choiceZ', label='Choose conditioning variable', 
       choices=c('Species richness'='SpNat', 'Forest cover'='NBT', 'Pest control'='PC')), 
#checkbox input for pairs plots: 
    tags$h3('Select variables for pairs plots'), #heading 
    checkboxGroupInput(inputId='vars', label='Choose at least two variables for pairs plot', 
        selected=c('SpNat', 'NBT', 'PC'), #'determines which vars start off checked. Important for pairs, cos <2 and plot wont work. 
        choices=c('Species richness'='SpNat', 'Forest cover'='NBT', 'Pest control'='PC')), #***Server receives input as a single concatenated text 

#slider input for prediction: 
    tags$h3('Predicting forest cover'), #heading 
    sliderInput(inputId='num',label='Pick a forest cover level', value=10, min=1, max=100)), 

    mainPanel(                #everything nested in here will go in main panel 
#specify output for app, including headings: 
    tags$h3('Coplot:'), 
    plotOutput(outputId='coplot'), 
    tags$h3('Histogram:'), 
    plotOutput(outputId='pairs'), 
    tags$h3('Predicted species richness:'), 
    verbatimTextOutput('prediction')))) 

#========== 
# server section 
#========== 

server <- function(input, output){ 
    # Read in data 
    myDF <- read_excel('data/MyShinyData.xlsx') #don't need full path 
    myDF$PC <- as.factor(myDF$PC) 
    myDF <- select(myDF, SpNat, NBT, PC) 

    #create output object, and name it so it corresponds to the ui output function ID, plus use the ui input ID to create it: 
    output$coplot <- renderPlot(
    ggplot(myDF, aes_string(input$choiceX, input$choiceY, col=input$choiceZ)) + geom_point()) #note use of aes_string to allow inputID use direct. 
    output$pairs <- renderPlot({ 
    pairs.panels(subset(myDF, select=input$vars))}) 
    output$prediction <- renderPrint({ 
    newData <- data.frame(NBT=input$num) 
    cat(predict(m1, newdata = newData)) 
    }) 
} 

#========== 
# and stitch together 
#========== 

shinyApp(ui=ui, server=server) 

Answer 1

想通了。我有两个问题：

（1）我在发布之前将应用程序复制到了一个新文件夹中，因此工作目录已更改 - 在运行shinyapps::deployApp之前需要重置为包含我的app.R文件的文件夹。 （2）我的应用程序需要的几个包自动加载到我的R控制台中（我对我的.Rprofile文件进行了更改）。所以虽然我不需要加载这些来在本地运行应用程序，但我确实在线发布了它。

这两个很愚蠢的错误，但你生活和学习。