如何保持文件中的行数据，直到文件python

Question

以后遇到条件我怀疑这是一个重复的问题，但我已经搜索了一段时间，似乎没有正确的措辞找到这个问题的答案。对不起，如果它是提前重复！

我试图从我正在逐行阅读的文件中打印下列信息。

基因1基因2基因0 *基因1基因2

*代码

我已经能够得到gene0，基因1，基因2被称为非编码RNA基因，但我有麻烦试图找出如何缓冲基因-1和基因-2，直到符合条件基因0（数据[2] = ncRNA）。

换句话说，我需要从先前的行中获得可变信息，但只有当满足当前行中的条件时才可以。我已经在下面的注释部分中想到了它，但似乎必须有更好的方法来做到这一点（这将是一个嵌套混乱）。我正在浏览的文件是一个gff文件。

我不知道如何为'先前的信息'做一个占位符，直到满足条件。

import sys 
import re 
gff3 = sys.argv[1] 
f = open(gff3, 'r') 

ncRNAgene= False 
fgene_count=0 

while True: 
    line = f.readline() 
    if not line.startswith('#'): 
     data = line.strip().split("\t") 
     ### this is not important to the question, just me dealing with the file format 
     try: 
      #my mis-guided attempts to get at this issue 
      #if data[2] == gene: 
      #line0 = f.readline() 
      #data0 = line.strip().split("\t") 
      #if data0[2] == gene 


     ### the relevant information is in the third column of the line 
      if data[2] == 'ncRNA': 
       ncRNAgene = True 

       print "ncRNA gene:", line 

       while fgene_count <= 1 and ncRNAgene: 
        line = f.readline() 
        data2 = line.strip().split("\t") 
        if data2[2] == 'gene': 
         fgene_count = fgene_count + 1 

         print "this is gene %s : %s" %(fgene_count, line) 

      if fgene_count > 1: 
       fgene_count = 0 
       ncRNAgene= False 

      else: 
       continue 

    except IndexError: 
      if line.startswith('>'): 
       break 
    if not line: 
     break 

f.close() 

这是我很感兴趣的样子文件的一部分：我在方括号内的东西，我很感兴趣，

211000022279165 FlyBase [外显子] 14 1118。 - 。父母= FBtr0300167; parent_type = ncRNA

211000022279165 FlyBase [基因] 14 1118。 - 。 ID = FBgn0259870;名称= Su（Ste）：CR42439;全名= Su（Ste）：CR42439;别名= CR42439; Ontology_term = SO：0000011，SO：0000087; Dbxref = FlyBase_Annotation_IDs：CR42439，EntrezGene：7354392，GenomeRNAi：7354392

211000022279165 FlyBase [ncRNA] 14 1118。 - 。 ID = FBtr0300167;名称=苏（STE）：CR42439-RA;父= FBgn0259870; ALIAS = CR42439-RA; Dbxref = FlyBase_Annotation_IDs：CR42439-RA，REFSEQ：NR_026633; score_text =弱支持;得分= 0

Answer 1

这里很难准确地说出你的意思，但是像这样的问题的一般想法非常简单：只需将gene1和gene2存储在本地变量中，只要找到gene1或gene2行，就更新本地变量，然后在您使用这些局部变量时找到gene0一行。

例如：

gene1, gene2 = None, None 
for line in file: 
    if matches_gene1(line): 
     gene1 = parse_gene1(line) 
    elif matches_gene2(line): 
     gene2 = parse_gene2(line) 
    elif matches_gene0(line): 
     gene0 = parse_gene0(line) 
     do_stuff_with(gene0, gene1, gene2) 
     gene1, gene2 = None, None 

或者，如果可以有多个各gene0之前gene1和gene2线，只是用它们的列表：

gene1, gene2 = [], [] 
for line in file: 
    if matches_gene1(line): 
     gene1.append(parse_gene1(line)) 
    elif matches_gene2(line): 
     gene2.append(parse_gene2(line)) 
    elif matches_gene0(line): 
     gene0 = parse_gene0(line) 
     do_stuff_with(gene0, gene1, gene2) 
     gene1, gene2 = [], []