并行foreach循环产生mclapply错误

这些是我在R中的并行计算的第一步。下面的代码导致以下错误。我无能为力，因为我写的内容中没有mclapply函数，至少我没有明确说明。并行foreach循环产生mclapply错误

错误：

Error in mclapply(argsList, FUN, mc.preschedule = preschedule, mc.set.seed = set.seed, : 
    (list) object cannot be coerced to type 'integer' 
Calls: %dopar% -> <Anonymous> -> mclapply 
Execution halted

代码：

dist<-array(0, dim=c(320,500,25)) 

mc<-8 
cl<-makeCluster(mc) 
registerDoMC(cl) 
opts<-list(chunkSize=10) 

for(a in 1:25) { 
    dist[,,a]<-foreach(x=1:500, .combine='cbind', .options.mc=opts) %:% 
    foreach(y=1:320, .combine='c') %dopar% { 
     gcd.slc(crdsx[y,x], crdsy[y,x], lot[a,5], lot[a,4]) 
    } 
} 
stopCluster(cl)

在不同的机器，它很好地与

registerDoParallel(cl)

，而不是

registerDoMC(cl)

来源

2013-06-28 user2530062

你可以添加sessionInfo（）到OP吗？ –

当你用'registerDoMC'注册一个并行后端时，函数'doMC'被设置为当你调用函数'％dopar％'时执行。 'doMC'包含对'mclapply'的调用，所以这就是它的来源。 – BenBarnes

由于registerDoMC需要整数参数而不是集群对象，而registerDoParallel需要整数或集群对象，因此会出现该错误。基本上，你需要决定使用哪个软件包，而不是混合它们。

如果您使用doMC，则永远不会创建群集对象。一个最小doMC例子如下：

library(doMC) 
registerDoMC(3) 
foreach(i=1:10) %dopar% sqrt(i)

的doParallel包是doMC和doSNOW包的混搭，所以你不需要使用集群对象。前面的例子转换为doParallel很简单：

library(doParallel) 
registerDoParallel(3) 
foreach(i=1:10) %dopar% sqrt(i)

混乱的事情是，在Windows上，doParallel实际上将创建并使用在幕后群集对象，而在Linux和Mac OS X，它不使用群集对象，因为它使用mclapply就像在doMC包中一样。我认为这很方便，但可能会造成混淆。

来源

2013-06-28 14:17:11

谢谢。在完成了各种软件包中的众多示例之后，我在半夜留下了registerDoMc（集群）。也许在第二个敏锐的想法之后的第二天早上从未问过这个问题......把整数作为参数并完全依靠doMC确实是我在寻找的东西，谢谢！ – user2530062

并行foreach循环产生mclapply错误

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