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我需要绘制3D对象的转变与时间之间的RMSD。我有在每一时刻的三维形状，但他们不能保证几何有利地位，所以我不能只是使它们和拍的照片汇集成一部电影。因此，我需要对齐它们，以便它们相对于相机愉快且始终如一地定向。最小化两组分
我会做的是采取对3D对象，相对于几何中心居中它们，然后围绕一些轴进行正确的旋转，从而最大限度地减少点之间的RMSD。这不是很难，但我会喜欢知道是否有东西准备好了有这么没有重塑数学（和代码）。当然，我也接受反对我的方法。
我在python工作，但任何代码就行了，我会把它转换。