编译使用mpi的库（AGMG）

用于并行例如make文件正在寻找这样的：

# MPIopt = -I/... (where to find mpif.h) 
# MUMPSPopt = -I/... (where to find files to be included by 
#      applications using MUMPS) 
# MUMPSlib = -l... (link reference for MUMPS) 
# SCALAP = -l... (link reference for SCALAPACK, needed by MUMPS) 
# BLASLAPACK= -l... (link reference for LAPACK & BLAS) 
# MPIlib = -l... (link reference for MPI)

在我的Debian mpif.h发现：

MPIopt = -I/usr/lib/openmpi/include/ 
MPIlib = -lmpi

：

$ ls /usr/lib/openmpi/include/mpi.h 
/usr/lib/openmpi/include/mpi.h

所以我在Makefile中写道：

但是从来没有那么少，当我尝试编译时，出现以下错误：

:~/AGMG_3.0/Example_par$ make 
cd ../SRC;make dpar 
make[1]: Entering directory `AGMG_3.0/SRC' 
make[1]: Nothing to be done for `dpar'. 
make[1]: Leaving directory `AGMG_3.0/SRC' 
gfortran-4.4 -O4 -o Example_par Example_par.o ../SRC/dagmg_par.o -lmpi 
Example_par.o: In function `MAIN__': 
Example_par.f90:(.text+0x77): undefined reference to `mpi_init_' 
.... 
.... 
.... 
dagmg_par.f90:(.text+0x19fc9): undefined reference to `mpi_comm_rank_' 
dagmg_par.f90:(.text+0x19fdd): undefined reference to `mpi_comm_size_' 
collect2: ld returned 1 exit status 
make: *** [Example_par] Error 1

我挺现在糊涂了，我不得不尝试是成功的，但比我有scaplap 和其他要求的问题。 scalap发现：

$ dpkg -L libscalapack-mpi-dev 
/. 
/usr 
/usr/lib 
/usr/lib/libscalapack-openmpi.a

腮腺炎在/usr/lib/libsmumps.a发现，头文件是/usr/include/smumps_c.h我

那么，如何把这个一起？

我知道，对于一个更先进的FORTRAN或C语言开发，这将是微不足道的......提前

感谢您的帮助。

编辑：我把这里全Makefile文件的定义，希望它可以帮助别人：

MPIopt = -I/usr/lib/openmpi/include -I/usr/lib/openmpi/lib -L/usr/lib/openmpi/lib -pthread 
MPIlib = -lmpi_f90 -lmpi_f77 -lmpi 
MUMPSPopt = -I/usr/lib/libsmumps.a -I/usr/lib/libdmumps.a 
MUMPSlib = -lsmumps -ldmumps 
BLASLAPACK=-L/usr/lib -llapack -lblas 
BLASLAPACK=-L/usr/lib -llapack -lblas 
SCALAP = -L/usr/lib/libscalapack-openmpi.a -lscalapack-openmpi 

F90=gfortran-4.6

这建立它。谢谢你的回复！

来源

2012-03-05 Oz123

这些是链接器错误。它看起来像你的包含文件已被成功拾取，但链接程序没有看到MPI库。尝试将MPIlib = -lmpi更改为包含libmpi.a的路径，例如MPIlib = -L/usr/lib/openmpi/lib -lmpi

或者，按照@haraldkl的建议，尝试使用MPI编译器包装。这些应该自动连接到MPI。

来源

2012-03-05 22:09:24

谢谢！这告诉我如何去做！ -L/Path/to/Library.a -llibName！ – Oz123 2012-03-06 07:33:20

我想你错过了Fortran MPI库的东西。您应该使用安装的mpi编译器封装，通常称为mpif90。如果你想指定手动所有的图书馆，你可以在由包装器设置的选项一目了然与

mpif90 --showme

（对了openmpi）或一些类似的标志，这取决于你的MPI库。

来源

2012-03-05 21:48:07 haraldkl

感谢您的回答。虽然这向我展示了有关MPI的东西，但我仍然与其他库很苦恼。另一个答案告诉我如何为别人做，所以我接受了。 – Oz123 2012-03-06 07:32:04

编译使用mpi的库（AGMG）

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